AWS平行锁定GRAVITON REST API连接拒绝
我正在尝试使用AWS ParallelCluster（ AWS研究工作室）和一旦我启动云形式并运行，我就无法通过REST API连接到群集。我使用的是Slurm 21.08.8和Parall…
slurm-阵列两个变量
我有以下BASH脚本在HPC上使用 slurm ： #!/bin/bash #SBATCH --job-name test #SBATCH --ntasks 10 #SBATCH --time 00-01:00 #SBATCH --output out #S…
在slurm上多处理不使用多个CPU
我在浆液群上，想运行以下多进程。这些任务是完全可行的，但似乎它们仍在串行中发生。 代码是： #load data (this is a df of files that need to be …
强制执行SRUN在单个插座上使用独家核心
我正在使用 sbatch ，并且有一个带有2个插座的节点，每个节点有18个内核，总计36个内核。我正在启动4个脚本，每个脚本都有两个共享GPU的任务： #SBATC…
在旧群集中使用Slurm（和PBS）的Oneapi的Mpirun错误
最近，我安装了Intel Oneapi，包括C编译器，Fortran编译器和MPI库，并遵守了VASP。 在提出问题之前，我需要在安装VASP时需要澄清一些技巧： Glibc2.14…
Sharp＆＃x2b; bash中的某种格式是否常见？
这可能是重复的或太幼稚的问题，但是我找不到可以在Google上搜索的合适关键字。我正在使用SGE和Slurm的一些示例BASH脚本学习，我无法完全弄清楚其背后…
dask-error：无法序列化类型元组的对象
我正在尝试使用 dask 在基因组数据上运行模型。但是，当我标准化或处理数据时，我会遇到错误。 我正在研究A slurm cluster 。因此，首先我要启动一个…
在调用srun的可执行文件上调用sbatch
如果我有一个包含sbatch选项的bash脚本，该选项指定在运行脚本之前需要可用的资源，而在该脚本中，则不是一系列的srun命令，我有一个可执行的可执行文…
调用dask调度程序故事功能时出错
因此，我在Dask文档中遵循此示例几乎逐字 https://dasteributed.dask.orgg/en/stable/ logging.html＃task-transition-logs 但不能让它起作用。以下是…
＆quot“ snakemake”使用多个节点和slurm-ClusterProfile致电Mpirun
我正在编写一个snakemake-workflow，该工作流使用slurm-job中使用docker-image的Mpirun调用一个过程。有必要使用多个计算节点和许多过程。我正在为Slu…
AssocmaxWallDurationPerjoblimit在Slurm中意味着什么？
我提交了一份工作，但我得到了： 253 x86 brando_j miranda9 PD 0:00 1 (AssocMaxWallDurationPerJobLimit) 这是什么意思？ 我的sbatch脚本如下： #!/…
是否有一种干净的方法可以在单个节点上运行NextFlow（基于DSL2）的子工作流？
我在子工作流中定义了一个管道： workflow pipeline{ main: task1() task2(task1.out) ... } 由主工作流来调用不同输入： workflow{ params.in = "$ba…
