从New Git Branch上在集群上启动Slurm Jobs
我有一些代码,上面有两个git分支,分支1 和分支2 。我一直在使用shell脚本在计算群集上启动slurm作业(通过 sbatch shell_script.sh 在终端中运行朱…
在slurm脚本中指定git分支
我正在远程计算集群上运行slurm作业提交文件。该作业调用了一个git存储库下的一些脚本,该脚本具有两个分支 main 和 test_branch 。在远程群集的目录…
Slurm Job Array无法使用ShapeFiles运行RScript
我想通过slurm在HPC群集上运行一个作业阵列,将单个圆形的型号与大量的人口普查块相交,然后保存所得的相交Shapefile。然后,我将这些单独的Shapefile…
与slurm和奇异性不一致的行为不一致
我是使用Slurm向HPC提交工作的新手,并且面临一个我无法解决的特殊问题。 我有一个job.slurm文件,其中包含以下bash脚本 #!/bin/bash #SBATCH --job-n…
Slurm:SRUN内部的Sbatch被忽略 /跳过,谁能解释为什么?
我仍在探索如何使用Slurm调度程序,这次我真的被卡住了。以下批处理脚本不起作用: #!/usr/bin/env bash #SBATCH --job-name=parallel-plink #SBATCH …
仅当两者都获得分配的资源时,才能运行2个Slurm作业
提交一项工作以持有4 GPU。第二个提交以获取接下来的4个GPU(在不同的节点上)。我如何确保两个作业同时运行,以最终同步(Pytorch DPP)。 拥有一个…
Slurm可以执行SRUN
Slurm无法 srun -n 1 /home/user/share/test/hello.o 运行 rpi40000:0 of 1 ,但是 srun -n 2 /home/user/share/test/hello.o 错误。 srun:错误:sl…
我可以递归地致电sbatch吗?
我想运行一个运行并创建检查点文件的程序。然后,我想运行几个从该检查点开始的变体配置。 例如,如果我运行: sbatch -n 1 -t 12:00:00 --mem=16g pr…
在slurm上使用openMPI运行多个节点
我正在尝试使用OpenMPI和Slurm来运行一个简单的Hello World程序。目的是使用以下#sbatch脚本。 在bashrc中,我添加了%path 和%ld_library_path ,它…
Slurm控制器无法连接到工人,状态被设置为未知
我正在尝试设置一个由Slurm管理的小集群。控制器也是计算节点。 /etc/slurm/slurm.conf IN Config In 是: NodeName=controller,node[01-02] RealMemo…
Slurm中有什么原因不超过一定数量的节点?
我想从大约2,000个阵列中在GCP-SLURM中运行约400个工作。 我的bash文件中的slurm设置和slurm.config设置如下。 run.sh #SBATCH -o ./out/vs.%j.out #S…
单slurm数组与多个sbatch调用
我可以通过使用 slurm 数组来运行 n 令人尴尬地并行作业,例如: #SBATCH --array=1-N 或通过手动启动8个工作。例如,使用带有循环的简单bash脚本。 …
在同一群集节点上的两个openMP程序的两个同等运行的CPU使用中的不同%
使用 slurm 两个不同的参数 c ++ openMP >在两个不同的目录上。每个线程的数量为 20 。但是一个程序正在使用 1700-2000%CPU (还可以),另一个程序…
slurm群集:配置节点,并非所有内核都具有等量的数字线程
我有一个新的节点,我正在尝试将其添加到slurm群集中。新机器上的内核并非都具有相同数量的螺纹:6个内核每个有2个螺纹,4个核有1个线程,总计16个CPU…