我怎样才能监控CPU? Slurm 工作的效率如何?
我开发了一个支持多线程的 Python 脚本。我将代码发送到 Slurm。我想验证多线程是否正常工作。 因此我想监控实时CPU的使用情况。有什么命令可以做到这…
使用超过 1 个节点进行 mpi 作业时出现分段错误
我目前正在寻找与管理和最大化我从国家 HPC 服务访问的资源相关的问题的解决方案。 该服务有 2 个相关的主要队列:1) Intel Xeon Gold 6148 Skylake …
在slurm资源指令中使用snakemake使用通配符
我正在使用 Snakemake 创建规则并通过 slurm 在我们的 HPC 上提交作业。为了使输出“更漂亮”,我希望能够在资源指令中设置 job_name 参数,以便将使…
运行多个文件作业用一个sbatch
我想运行n个文件(n个作业),这些文件(n个作业)在我的pwd中的n个文件夹中: Folder_1 contains file_1 Folder_2 contains file_2 | | | Folder_N c…
是什么导致了我的随机:“joblib.externals.loky.process_executor.TermulatedWorkerError”错误?
我正在制作基于GIS的数据分析,在该分析中,我计算了全国范围的广泛预测图(例如天气地图等)。因为我的目标区域非常大(整个国家),所以我使用的是…
Pytorch从Slurm Job中发现超过1 GPU
我正在使用 SLURM 从超级计算机为我的 ML 作业分配一些 GPU 节点。 对于单个 GPU(1 个节点),一切正常,但当为超过 1 个作业设置 SLURM 脚本时,pyt…
使用 DistributedDataParallel 的多节点处理给我一个权限被拒绝的错误
我正在尝试在大学超级计算机上使用 Pytorch 的 DistributedDataParallel 实现多节点作业,我使用端口 22 通过 ssh 登录。 " rel="nofollow noreferrer…
MPI通过slurm结合秩与特定节点
我使用 sbatch 来分配具有(比方说)8 个等级的 MPI 作业。 我使用 4 个节点:node0[01-04]。 我想将排名 0 绑定到第一个节点 (node001),将其他排名…
运行Python文件SLURM - 访问数据
每个人!我是 SLURM 领域的新手,所以如果这个问题看起来很愚蠢,我很抱歉。 我必须使用一个无法保存在我的电脑中的庞大数据库,因此我可以访问 SLURM…
如果第一个命令未分配,则通过 slurm 调度程序暂停 os.system 命令
我在多节点集群上多次运行脚本,并且该脚本在集群上按顺序处理数据。这是代码: import os os.system("srun -p rs2 --mem-per-cpu 200G -t 7-23:00:00…