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如何读取文件并为每一行记录

寻求有关编写 Perl 程序的帮助,该程序接受输入文件并根据后续命令执行操作。我是一名 Perl 初学者,所以请不要给出太提前的建议。到目前为止我的结构…

衣神在巴黎 2024-10-06 12:31:30 4 0

如何解析文件、创建记录并对记录执行操作,包括术语频率和距离计算

我是 Perl 入门课程的一名学生,正在寻找有关我编写一个分析原子数据的小型(但棘手)程序的方法的建议和反馈。我的教授鼓励论坛。我对 Perl 子程序或…

南…巷孤猫 2024-10-06 10:22:12 3 0

查找两个字符串中的碱基重叠计数和内部间隙

我有两个长度相等的字符串,我需要对其进行比较。 我想找到重叠基数(.) 和内部间隙(*)。下面是示例: ------ACTAAAAATACAAAAA--TTAGCCAGGCGTGGTGGCAC …

浮云落日 2024-10-05 15:00:08 2 0

Perl 程序使用引用、哈希表和子集来模拟限制性内切酶

我是 Perl 入门课程的学生。我正在寻找有关如何完成任务的建议。我的教授鼓励论坛。任务是: 编写一个 Perl 程序,该程序将从命令行获取两个文件:一…

瑕疵 2024-10-04 23:48:40 4 0

高效的经验CDF计算/存储

我正在尝试预先计算几个随机变量的分布。特别是,这些随机变量是在基因组中的位置评估函数的结果,因此每个变量的值约为 10^8 或 10^9。这些功能非常…

无尽的现实 2024-10-04 01:46:53 6 0

使用 perl 脚本编辑帮助以在数组中的特定位置启动和停止

寻找故障排除和编辑帮助。这是一项家庭作业。我的教授鼓励使用论坛。我还没有 Perl 函数或 Subs 的经验,所以请将回复限制在适当的水平,以便我能够理…

少女的英雄梦 2024-10-01 11:09:10 4 0

模拟 RNA 合成的 Perl 程序

寻找有关如何完成我的 Perl 编程作业以编写 RNA 合成程序的建议。我总结并概述了以下计划。具体来说,我正在寻找有关以下块的反馈(我将编号以便于参…

合久必婚 2024-09-30 21:13:22 3 0

如何在Matlab的生物信息学工具箱中使用其他聚类方法进行聚类图

编辑:我想通了。只是不明白符号。 您好, 希望有人熟悉生物信息学工具箱中的聚类图。我对该函数的图形方面(树状图/热图)感兴趣,但目前我有障碍,…

半寸时光 2024-09-28 16:38:33 4 0

子类/子类

我有这个类和子类: 类别范围: def __init__(self, start, end): self.setStart(start) self.setEnd(end) def getStart(self): return self.start de…

如果没有你 2024-09-28 04:47:24 3 0

当我从网络运行 CGI 脚本时,为什么 python 找不到某些模块?

我不知道这里可能出现什么问题: 我有一些来自 Biopython 的模块,当使用交互式提示或通过命令行执行 python 脚本时,我可以轻松导入这些模块。 问题…

躲猫猫 2024-09-24 13:49:50 5 0

组织生物信息学项目的最佳方式?

Closed. This question is opinion-based. It is not currently accepting answers. 想要改进这个问题?更新问题,以便可以通过编辑这篇文章用事实和…

可是我不能没有你 2024-09-24 00:20:12 4 0

以编程方式获取blastn数据库

在 核苷酸BLAST搜索页面 有没有办法以编程方式获取“选择搜索集”框中列出的数据库? 也许是 XML 格式? (使用的编程语言并不重要)…

眼睛会笑 2024-09-19 11:14:27 7 0

如何可视化基因网络和基因聚类组?

我正在处理生物数据——即基因组。例如: group 1: geneA geneB geneC group 2: geneD geneE group 3: geneF geneG geneH 对于每对基因,geneX 和 gen…

心如荒岛 2024-09-19 02:31:31 6 0

需要 Perl 中峰值信号检测的帮助

大家好,我从酵母菌落板的图像中得到了一些强度值。我需要能够从强度值中找到峰值。下面的示例图像显示了绘制图表时值的外观。 一些值的示例 5.7 5.3 …

帥小哥 2024-09-15 11:01:48 7 0

对于计算机科学家来说,最好的生物信息学书籍是什么?

Closed. This question is seeking recommendations for software libraries, tutorials, tools, books, or other off-site resources. It does not …

岁月静好 2024-09-15 08:49:27 7 0
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