在 Ruby 中处理染色体数据
假设我有一个正在使用 Ruby 处理的染色体数据文件, #Base_ID Segment_ID Read_Depth 1 100 2 800 3 seg1 1900 4 seg1 2700 5 1600 6 2400 7 200 8 15…
R:ape/phylobase:无法将超度量、二叉树转换为 hclust 对象(警告消息)
我使用 ape 函数和 ape 包的 read.tree 函数在 R 中导入了 ClustalW2 树。我使用 chronopl 函数估计分子年龄,从而生成超量度二叉树。我想从中创建树…
如何解析文件、创建记录并对记录执行操作,包括术语频率和距离计算
我是 Perl 入门课程的一名学生,正在寻找有关我编写一个分析原子数据的小型(但棘手)程序的方法的建议和反馈。我的教授鼓励论坛。我对 Perl 子程序或…
查找两个字符串中的碱基重叠计数和内部间隙
我有两个长度相等的字符串,我需要对其进行比较。 我想找到重叠基数(.) 和内部间隙(*)。下面是示例: ------ACTAAAAATACAAAAA--TTAGCCAGGCGTGGTGGCAC …
Perl 程序使用引用、哈希表和子集来模拟限制性内切酶
我是 Perl 入门课程的学生。我正在寻找有关如何完成任务的建议。我的教授鼓励论坛。任务是: 编写一个 Perl 程序,该程序将从命令行获取两个文件:一…
使用 perl 脚本编辑帮助以在数组中的特定位置启动和停止
寻找故障排除和编辑帮助。这是一项家庭作业。我的教授鼓励使用论坛。我还没有 Perl 函数或 Subs 的经验,所以请将回复限制在适当的水平,以便我能够理…
如何在Matlab的生物信息学工具箱中使用其他聚类方法进行聚类图
编辑:我想通了。只是不明白符号。 您好, 希望有人熟悉生物信息学工具箱中的聚类图。我对该函数的图形方面(树状图/热图)感兴趣,但目前我有障碍,…
当我从网络运行 CGI 脚本时,为什么 python 找不到某些模块?
我不知道这里可能出现什么问题: 我有一些来自 Biopython 的模块,当使用交互式提示或通过命令行执行 python 脚本时,我可以轻松导入这些模块。 问题…
组织生物信息学项目的最佳方式?
Closed. This question is opinion-based. It is not currently accepting answers. 想要改进这个问题?更新问题,以便可以通过编辑这篇文章用事实和…