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在 Ruby 中处理染色体数据

假设我有一个正在使用 Ruby 处理的染色体数据文件, #Base_ID Segment_ID Read_Depth 1 100 2 800 3 seg1 1900 4 seg1 2700 5 1600 6 2400 7 200 8 15…

一抹淡然 2024-10-10 08:05:45 0 0

生物信息学的 Silverlight 演示

我是一名初级Silverlight程序员,准备参加医学研究公司的面试。工作听起来非常有趣,我想去那里。 为了展示我的技能和兴趣,我想编写一个与该主题相关…

倒数 2024-10-10 02:20:17 0 0

如何在 R 中执行基本的多序列比对?

(我曾尝试在 BioStars 上询问这个问题,但有可能有人通过短信挖掘会认为有更好的解决方案,我也在这里重新发布) 我想要实现的任务是对齐几个序列。 …

深府石板幽径 2024-10-08 14:17:45 1 0

R:ape/phylobase:无法将超度量、二叉树转换为 hclust 对象(警告消息)

我使用 ape 函数和 ape 包的 read.tree 函数在 R 中导入了 ClustalW2 树。我使用 chronopl 函数估计分子年龄,从而生成超量度二叉树。我想从中创建树…

冰雪梦之恋 2024-10-07 06:03:04 0 0

如何读取文件并为每一行记录

寻求有关编写 Perl 程序的帮助,该程序接受输入文件并根据后续命令执行操作。我是一名 Perl 初学者,所以请不要给出太提前的建议。到目前为止我的结构…

衣神在巴黎 2024-10-06 12:31:30 0 0

如何解析文件、创建记录并对记录执行操作,包括术语频率和距离计算

我是 Perl 入门课程的一名学生,正在寻找有关我编写一个分析原子数据的小型(但棘手)程序的方法的建议和反馈。我的教授鼓励论坛。我对 Perl 子程序或…

南…巷孤猫 2024-10-06 10:22:12 0 0

查找两个字符串中的碱基重叠计数和内部间隙

我有两个长度相等的字符串,我需要对其进行比较。 我想找到重叠基数(.) 和内部间隙(*)。下面是示例: ------ACTAAAAATACAAAAA--TTAGCCAGGCGTGGTGGCAC …

浮云落日 2024-10-05 15:00:08 0 0

Perl 程序使用引用、哈希表和子集来模拟限制性内切酶

我是 Perl 入门课程的学生。我正在寻找有关如何完成任务的建议。我的教授鼓励论坛。任务是: 编写一个 Perl 程序,该程序将从命令行获取两个文件:一…

瑕疵 2024-10-04 23:48:40 0 0

高效的经验CDF计算/存储

我正在尝试预先计算几个随机变量的分布。特别是,这些随机变量是在基因组中的位置评估函数的结果,因此每个变量的值约为 10^8 或 10^9。这些功能非常…

无尽的现实 2024-10-04 01:46:53 0 0

使用 perl 脚本编辑帮助以在数组中的特定位置启动和停止

寻找故障排除和编辑帮助。这是一项家庭作业。我的教授鼓励使用论坛。我还没有 Perl 函数或 Subs 的经验,所以请将回复限制在适当的水平,以便我能够理…

少女的英雄梦 2024-10-01 11:09:10 1 0

模拟 RNA 合成的 Perl 程序

寻找有关如何完成我的 Perl 编程作业以编写 RNA 合成程序的建议。我总结并概述了以下计划。具体来说,我正在寻找有关以下块的反馈(我将编号以便于参…

合久必婚 2024-09-30 21:13:22 0 0

如何在Matlab的生物信息学工具箱中使用其他聚类方法进行聚类图

编辑:我想通了。只是不明白符号。 您好, 希望有人熟悉生物信息学工具箱中的聚类图。我对该函数的图形方面(树状图/热图)感兴趣,但目前我有障碍,…

半寸时光 2024-09-28 16:38:33 1 0

子类/子类

我有这个类和子类: 类别范围: def __init__(self, start, end): self.setStart(start) self.setEnd(end) def getStart(self): return self.start de…

如果没有你 2024-09-28 04:47:24 1 0

当我从网络运行 CGI 脚本时,为什么 python 找不到某些模块?

我不知道这里可能出现什么问题: 我有一些来自 Biopython 的模块,当使用交互式提示或通过命令行执行 python 脚本时,我可以轻松导入这些模块。 问题…

躲猫猫 2024-09-24 13:49:50 0 0

组织生物信息学项目的最佳方式?

Closed. This question is opinion-based. It is not currently accepting answers. 想要改进这个问题?更新问题,以便可以通过编辑这篇文章用事实和…

可是我不能没有你 2024-09-24 00:20:12 1 0
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