dna-sequence

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从几个给定的集合中生成所有可能的 DNA 序列

我已经尝试解决这个问题有一段时间了,但一直无法想出一个好的解决方案。这里是: 给定多个集合: set1: A, T set2: C set3: A, C, G set4: T set5: G…

祁梦 2024-08-12 21:46:02 18 0

如何使用替换矩阵修改 Smith-Waterman 算法以在 Perl 中对齐蛋白质?

如何使用 Smith-Waterman 算法 修改Perl 中对齐蛋白质的替换矩阵? [需要引用]…

黯淡〆 2024-08-10 08:38:12 19 0

根据常见的子模式对短的同质字符串(DNA)进行聚类并提取类别的共识

任务: 将大量短 DNA 片段聚类到共享共同子序列模式的类别中,并找到每个类别的共有序列。 泳池:约。 300 个序列片段 每个片段 8 - 20 个字母 4 个可…

糖粟与秋泊 2024-08-06 08:39:19 17 0

Perl 递归技术?

我需要一些关于这段代码的帮助。我知道应该递归的部分,或者至少我认为我知道,但不确定如何实现它。我正在尝试从对齐矩阵实现路径查找程序,该程序将…

沫离伤花 2024-08-05 07:35:06 17 0

生成具有取代率的合成 DNA 序列

给定这些输入: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw( A C G T ); 我想生成: 一千…

风筝有风,海豚有海 2024-07-14 13:02:23 15 0
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