如何从FastQ文件中提取唯一的读取ID?
我想在FastQ文件中提取所有唯一的读取ID,并将唯一的读取ID输出到文本文件中。 (我使用samtools完成了BAM文件的同一任务,但我不知道任何可以处理Fas…
如何删除文件中的重复行?
我知道一般方法是使用类似的方法 $ sort file1.txt | uniq > file2.txt ,但我想知道是否有一种方法可以在不需要单独的源和目标文件的情况下进行此操…
根据两列排序并根据上一列提取前两个
我有一个带有三列的文件。我想在第2列中为每个唯一值的第3列中的排名第两个值提取行。 cat file.list run1/xx2/x2c1.txt 21 -190 run1/xx2/x2c2.txt 1…
在文本文件中对空间分离的ID进行了不同的处理
输入文件看起来像这样: 123 456 456 869 123 562 562 123 如何找到ID的总量? 到目前为止,我尝试的是: cat file | tr " " "\n" | sort | uniq -c …
在rails中,如何在与其他模型连接后获取模型的所有参数,获取 ActiveRecord::Relation ,其中 count 的方法返回一个数字
假设我有以下模型: class Item # (name, price, location, quantity) has_many :purchases end class Purchase has_many :items belongs_to :person …
如何使用 uniq -c 选项进行自定义格式化?
来自维基百科: uniq -c 以默认样式生成输出报告,只不过每行前面都有其发生的次数计数。如果指定此选项,则 -u 和 -d 选项中的一个或两个都存在时将…
将 2 个文件合并到第三个文件中,使用列作为索引并合并行
我一直在学习 awk,遇到一个我无法解决的问题,如果可以的话请帮忙。 我有 2 个使用 awk、sort 和 uniq -c 生成的文件。 文件 1 的格式为: 1 aaa.c 1…
使用 Bash For 循环搜索文件中的唯一行
我有一个带有文件名列表的文件 sortedfile.txt 。我正在搜索另一个文件 ngfilelist.txt,其中包含 sortedfile.txt 中所有重复文件的文件列表。 我正在…
从日志中对唯一的 url 进行排序
我需要从网络日志中获取唯一的 URL,然后对它们进行排序。我正在考虑使用 grep、uniq、sort 命令并将其输出到另一个文件 我执行了这个命令: cat acce…
解释 Ruby Array uniq 方法的一个表达式
c = %w(a b c d) 1.8.7 :025 > c.uniq {|x|x[/^a/]} => ["a", "b"] 1.8.7 :026 > c.uniq {|x|x[/^b/]} => ["a", "b"] 1.8.7 :027 > c.uniq {|x|x[/^c/…
使用 unix sort、uniq 和 awk 替换 SQL 查询
目前,我们在 HDFS 集群上有一些数据,我们在这些数据上使用 Hive 生成报告。基础设施正在退役,我们剩下的任务是提出生成数据报告的替代方案(我…