lifelines.coxphfitter-如何计算p值?
我假设Lifelines.coxphfitter正在使用似然比测试(或使用Wald?)在测试显着性时计算P值。但是我必须确定:是否有官方消息来源可以找到使用什么测试?…
在精确时间显示特定于癌症的生存(Kaplan Meier的寿命)
kmf.survival_function_ (LifeLines Package) 在不同时间(0、4、6 ... 128个月),我向我展示了我的队列的癌症特定生存期(CSS)。 CSS如何在120个月…
当用coxph(生存包)中的分层变量上的模型诊断时出错
我有一个数据集,其中有3个小组收到了对不同媒体的接触。一组暴露于3个媒体中的1个。因此,我的coxph模型是分层的: # My treatment variable is load…
安装“ survhe”时,允许拒绝错误W Windows 11中的R软件包
通过以下方式更新survhe时,我总是会收到下面的错误消息: install.packages("remotes") remotes::install_github('giabaio/survHE', ref='hmc', forc…
为“生存:: surv()编写包装器功能,默认值
我最近一直在使用具有预先指定的列名称以及对生存数据编码方式的某些期望来构建的CDISC数据。 我想为使用CDISC格式的结构化数据编写一个生存:: surv(…
使用MLR3Proba模型的Survxai解释器
我正在尝试通过使用MLR3Proba构建的生存模型来构建Survxai解释器。我很难为解释器创建必要的预测函数。有没有人尝试过这样的东西? 到目前为止,我的…
Scikit-Learn管道返回所有NAN值
我是Python的新手,正在尝试教自己如何使用管道来进行功能预处理和模型拟合。我试图预处理我的数据(在CV采样下可能是常数的DROP功能,然后将其缩放)…
从分层性别分层的高表达的Cox危险模型计算出单个生存分析图
我有一组25个基因,我想从TCGA GDC门户表达数据中对癌症数据进行单一的生存分析图。为了定义表达值的高和低,我使用了生存分析管道,并使用z得分分配…
使用R将数据分组崩溃以获得新的权重,但仍获得无限范围
我有一个神经外科患者的数据集,我正在创建生存曲线。我正在尝试调整曲线,以匹配2000年美国人口的年龄分布,该分布包含在R生存包中。此“ USPOP2”数…
如何用寿命绘制生存概率校准?
我正在尝试使用 rosevial_probibality_calibration 可视化Cox模型的性能,但是校准曲线将始终保持平坦,如以下图所示: 带有cox模型的校准曲线 这…
使用比例危害参数化估算微小区域中的比例参数
根据 https:///www.stata.com/stata.com/stata.com/statalist/archive/ 2014-02/msg00188.html ,我必须定义 b = _b [_cons], 但我不知道那是什么含…
种子发芽数据:将时间数据从短格式转换为长格式以进行生存分析
我正在使用生存分析评估幼苗的出现率,我想自动化将简短表格收集的数据转换为R中的长形式进行分析的过程。 这是收集到的数据格式和日期转换的一个示例…
用coxph制作ggsurvplot
我已经从倾向分数匹配的数据集中对以下 coxph 对象进行了编码 cox <- coxph(Surv(INTERVAL, PX_STAT_CODE) ~ TX_NUM, data = outcomes_1and2above, ro…