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qalter 删除提前预订

我想创建一个数组作业,其中的任务并不同时执行。这些任务将通过一些未来的命令来启用。我需要此功能的原因是我想要聚合许多相关作业,但所有作业所需…

猫九 2024-11-07 10:29:16 0 0

将 Perl 生成的脚本提交到 SGE 时捕获作业 ID

Perl 无法打开同时运行的命令管道,这会导致通过 qsub 提交到 SGE 时出现问题,因为我丢失了提交的作业 ID。如何将生成的脚本提交给 SGE 并捕获 SGE …

本宫微胖 2024-11-03 08:26:55 1 0

SGE - QSUB 无法在同步模式下提交作业

我有一个 perl 脚本,它准备文件以输入到二进制程序,并将二进制程序的执行提交到 SGE 排队系统版本 6.2u2。 使用 -sync y 选项提交作业,以允许父 Pe…

寂寞笑我太脆弱 2024-10-15 11:39:29 3 0

在集群上加载库

我在我们这里的集群上使用 boost 成功编译了一个 C++ 程序。我需要运行 SGE 脚本来运行模拟。我得到的错误是这样的 ./main: 加载共享时出错 库:libbo…

潇烟暮雨 2024-10-12 20:24:28 2 0

在 GridEngine 集群的多个节点上运行作业

我可以访问一个 128 核集群,我想在该集群上运行并行作业。该集群使用 Sun GridEngine,我的程序编写为在 Python 2.5.8 上使用并行 Python、numpy、sc…

末骤雨初歇 2024-09-26 11:54:54 3 0

将输出重定向到 Sun Grid Engine 阵列作业的不同目录

我正在使用 Sun Grid Engine 运行很多作业。由于这些是作业(~100000),我想使用数组作业,这在队列中似乎更容易。 另一个问题是每个作业都会生成一…

月竹挽风 2024-09-19 02:33:19 5 0

Sun Grid Engine 上的超时作业

我正在使用 Sun Grid Engine (Linux) 运行很多工作。有些工作需要(非常)长时间才能运行,而且我不知道哪些工作会提前。 我想停止运行时间超过 2 小…

霞映澄塘 2024-09-16 00:17:23 3 0

在 Sun Grid Engine (SGE) 中将作业分布到集群的不同节点上

我正在尝试让 sun gridending (sge) 在集群的所有节点上运行 MPI 作业的单独进程。 实际情况是每个节点都有 12 个处理器,因此 SGE 将 60 个进程中的 …

韬韬不绝 2024-09-12 11:38:56 8 0

从 Sun Grid Engine 上使用 qsub 提交的进程获取退出代码

我想通过 Sun Grid Engine(现在:Oracle Grid Engine?)上的 qsub 提交作业。我不想使用 -sync yes 选项或 qrsh,因为我希望我的控制程序是单线程的…

苏辞 2024-09-06 05:13:34 7 0

如何在SGE排队系统中指定ppn(在PBS上)的等价物?

有没有办法在 SGE 中指定 ppn (或等效的)?我不想在一个节点中使用所有CPU,这样我就可以为每个核心拥有更多内存。 (例如,在 PBS 中,您可以执行 …

浅唱ヾ落雨殇 2024-09-03 21:27:08 5 0

如何更改 Sun Grid Engine 的默认 shell

Sun Grid Engine 默认为 csh,您必须将以下内容放入脚本中以避免它。什么全局配置设置会更改此默认值?…

z祗昰~ 2024-08-16 18:34:46 4 0

Condor、Sun Grid Engine 还是其他?

我正在尝试弄清楚我们是否应该在工作中尝试Condor或Sun Grid Engine(或者可能是其他东西)。 我们经常有很多未使用的 WinXp 工作站。我们希望能够使…

蓝礼 2024-08-13 09:21:26 6 0

在 SGE 作业中的集群上使用 tee 对 SIGTERM 进行故障排除

我有一些遗留的科学代码通过 SGE 在 Rocks 集群上运行。我有一个特定于应用程序的作业提交脚本,用于生成 qsub 脚本(即 Sun Grid Engine 获取并运行…

你不是我要的菜∠ 2024-08-12 03:18:08 6 0

使用C动态加载例程的问题

我有一个由用 C++ 编写的不同模块组成的应用程序。 其中一个模块用于处理 SunGrid Engine 上的分布式任务。 它使用 DRMAA API 提交和监控网格作业。如…

注定孤独终老 2024-07-26 06:22:46 5 0

打开共享对象时出错:SunGrid Engine

我的应用程序通过作为共享对象 libdrmaa.so 存在的 API DRMAA 使用 Sun N1 网格引擎 . 我正在使用 dlopen 和 dlsym 来访问库的函数。 效果很好。 现在…

苍暮颜 2024-07-25 14:38:54 3 0
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