与slurm和奇异性不一致的行为不一致
我是使用Slurm向HPC提交工作的新手，并且面临一个我无法解决的特殊问题。 我有一个job.slurm文件，其中包含以下bash脚本 #!/bin/bash #SBATCH --job-n…
在Visual Studio代码中使用奇异容器作为Python解释器
我通过VSCODE远程SSH连接到HPC环境，并希望直接在VSCODE中运行Python代码以进行测试。我想将Python解释器设置为一个奇异的容器，该容器在执行后运行Py…
使用容器环境变量绑定奇异性的路径
我有一个用 Scientific Filesystem ）应用程序。 我以奇异性运行-App MyApp image.sif 运行容器，因此，我有环境变量 scif_appdata =/scif/scif/data/…
构建奇异容器时，流浪机的记忆不足
我正在Mac上运行Vagrant，以创建一个奇异的容器，但用完了内存。我正在运行： sudo singularity build MY_CONTAINER.sif Singularity.recipe 我会遇到…
为了奇异性属性图像而增加硬和柔软的乌里米特的正确方法是什么？
我要完成的任务：我需要在一个奇异容域的内部运行一个Python软件包，该软件包要求至少打开一些9704个文件。这是我第一次听说过它，并在此处进行搜索与…
在奇异性外壳中提示之前运行脚本
我已经建立了一个带有Docker文件的Docker容器，该文件以 WorkDir/Where/I/Will/Work 结尾，当我旋转容器时，我可以上班。不幸的是，我的远程系统无法…
奇异性使用了哪种TMPSF分区？如何增加它
我想知道如何增加 tmpfs singularity sif 图像以及它与主机系统上的 tmpfs 的关系。根据A post 奇异性具有用于从sif图像文件呈现容器的标志。 - 可偿…
使用slurm运行python文件的正确方法是什么？
我使用的HPC要求我使用Slurm在计算上运行程序。目前，我在笔记本电脑上本地运行一个Python脚本，该脚本在循环中调用了一堆bash命令。例如，Python文件…
/var/cache/apt/archives中的错误“无自由空间”在奇异容器中，但磁盘不满
我正在尝试重现一份较旧的研究论文的结果，并且需要用NVIDIA CUDA 9.0和TORCH 1.2.0运行一个奇异的容器。 本地，我将Ubuntu 20.04作为VM，我在其中运…
从 gitlab 容器注册表中提取带有奇点的 docker 镜像时出错
我正在尝试使用 singularity pull 从我的 Gitlab 容器注册表中提取一个 docker 映像（因为我想使用它的奇异性），但我从奇异性中收到一个错误，告诉我…
如何验证是否在 Singularity|Apptainer 容器中？
根据 shell 文档： 提示的变化表明您已进入容器（尽管您不应该依赖它来确定您是否在容器中）。 那么除了提示符的变化之外，应该如何判断它们是否在容…
在 dockerfile 中安装奇点时出错
我正在尝试运行一个使用较旧版本的 nextflow (21.04.3) 和 java 版本 8 的 nextflow 管道。由于我必须在远程服务器上使用此管道，因此我只能使用奇点…
创建用户命名空间失败
我在 docker 映像中安装了奇异性和 nextflow，我想使用以下命令启动奇异性 pcm 映像： nextflow pcm.nf --allow-setuid --in example/example_proteom…
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