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获取 BLAST 结果的前 10 个序列 Bio Python

我想获得 BLAST 结果的前 10 个序列(只是序列,没有比对或分数或 e 值等)。我正在输入一个包含 5 个 fasta 文件的文本文件。所以我的输出应该是每个…

温柔一刀 2024-11-18 05:55:53 4 0

如何获得成对的“序列相似性评分”约 1000 种蛋白质?

我有大量 fasta 格式的蛋白质序列。 我想获得每对蛋白质的成对序列相似性得分。 R 中的任何包都可以用于获取蛋白质序列的blast 相似性评分吗?…

隔纱相望 2024-11-18 02:04:14 3 0

生成随机序列时的尴尬标准

我需要做什么才能生成给定范围内满足我的特定标准的非重复整数序列? 标准如下: 仅使用 1 到 MAX 之间的数字(假设为 9)。 数字在序列中不能重复,…

南冥有猫 2024-11-17 22:39:31 2 0

索引 HDFS 序列文件

索引非常大的序列文件(数百万个键/值对,其中每个值可以具有不同的长度,因此不能有随机访问方案)的最佳库/方法是什么?…

或十年 2024-11-17 19:44:58 3 0

当数组中的相同数字超过 3 个时,如何仅删除 3 个相同数字的实例?

假设我有一个数组,其中包含给定数字的重复次数超过 3 次。 我只想删除其中的三个重复项,并将数字的任何剩余实例保留在结果数组中。 例如: a = [2, …

貪欢 2024-11-17 18:38:33 2 0

PHP Postgres:获取最后插入 ID

我发现了关于这个主题的其他几个问题。这个... postgresql 的 mysql_insert_id 替代品 ...和 ​​手册似乎表明您可以随时调用 lastval() ,它的工作方…

一绘本一梦想 2024-11-17 17:40:57 3 0

Asterisk配置中的写入顺序会影响VoIP的性能吗?

伙计们!我的extensions.conf中有这样的配置, [globals] [general] autofallthrough=yes [lain-lain] [telpun] exten => 1000,1,Dial(SIP/tes) exten…

面如桃花 2024-11-17 12:38:24 3 0

Oracle 授予更改序列

我有一个授予更改序列给用户。但我必须指定模式名称来更改序列,否则它会返回错误序列不存在。是否可以以某种方式进行授权,这样我就不必指定架构名称…

澜川若宁 2024-11-17 09:41:59 5 0

以自定义方式对数组进行排序的算法

我正在寻找一种以自定义方式对数组进行排序的算法,但我没有成功找到解决问题的正确方法。我将使用类似 Django 的语法来描述代码,但没有必要仅限于 D…

澜川若宁 2024-11-17 04:17:48 1 0

测试一系列数字以确保它们符合序列 1,2,3...n

我正在尝试找到一个稍微更优雅的解决方案来查找数字序列是否有序。这是一个网络表单,我让用户有机会对项目进行编号并设置订单。我知道最大项目数,并…

把时间冻结 2024-11-16 17:05:30 1 0

Hibernate:使用 JPA 的单个实体中的两个序列

我有一个使用 JPA 注释的映射类,我希望它为两个字段使用两个单独的序列: @Entity @Table(name="my_table", schema="schema") @SequenceGenerator(na…

绿光 2024-11-15 19:31:22 4 0

序列成员的编号

我需要额外的 python 代码来对下面输出的左列进行编号,就像我在右列中所示的那样:这里的代码只是将序列分为 3 部分。 现在我想将它们从 1 编号到最…

强辩 2024-11-15 02:40:56 2 0

TLS 序列号

我正在写一篇有关 TLS 的大学论文,有人问我为什么 TLS 序列号计数器是 64 位数字,而 TLS 在其消息中仅使用 32 位序列号。我环顾了一段时间,甚至检…

吃素的狼 2024-11-14 16:53:23 1 0

Python正则表达式匹配字母序列

我想制作一个正则表达式来匹配“AGGH”、“TIIK”、“6^^?”或其他但不是“AGGA”、“ABCD”。基本上重要的是字母的模式。有没有办法询问您以前拥有或…

原谅过去的我 2024-11-14 15:57:53 3 0

如何处理很长的位序列?

让我们有一些序列 A,例如 {-1, 3, 2, 5}。我们可以使用迭代(二进制递增某个迭代器)来选择其所有非空子序列 1 .. 2^|A|: int i, A[] = {-1, 3, 2, …

一抹淡然 2024-11-10 03:24:58 2 0
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