Slurm Job Array无法使用ShapeFiles运行RScript
我想通过slurm在HPC群集上运行一个作业阵列，将单个圆形的型号与大量的人口普查块相交，然后保存所得的相交Shapefile。然后，我将这些单独的Shapefile…
Slurm：SRUN内部的Sbatch被忽略 /跳过，谁能解释为什么？
我仍在探索如何使用Slurm调度程序，这次我真的被卡住了。以下批处理脚本不起作用： #!/usr/bin/env bash #SBATCH --job-name=parallel-plink #SBATCH …
我可以递归地致电sbatch吗？
我想运行一个运行并创建检查点文件的程序。然后，我想运行几个从该检查点开始的变体配置。 例如，如果我运行： sbatch -n 1 -t 12:00:00 --mem=16g pr…
为什么crontab无法在我所需的目的地目录中显示我的rclone复制数据
我已经编写了一个bash脚本，以在两个遥控器之间复制一个完整的目录，这些遥控器（即我可以在其上使用sbatch命令复制到所需目的地的文件夹）。但是，当…
在调用srun的可执行文件上调用sbatch
如果我有一个包含sbatch选项的bash脚本，该选项指定在运行脚本之前需要可用的资源，而在该脚本中，则不是一系列的srun命令，我有一个可执行的可执行文…
绑定比Slurm OpenMPI中的CPU误差更多的过程
我正在尝试运行一项作业，该作业使用slurm上节点之间传递的明确消息（即不仅是运行并行作业），但是正在遇到一个反复出现的错误，即“提出与该请求绑…
如何使用bash从一个文件中汲取一系列字符串并在另一个文件中替换单独的一系列字符串？
我有两个文件：file1.txt和file2.txt，它们都在其他信息中都有一组坐标。 new_coords=$(sed -n '/Begin/,/End/{//b;p}' file1.txt) new_coords=$(echo…
运行多个文件作业用一个sbatch
我想运行n个文件（n个作业），这些文件（n个作业）在我的pwd中的n个文件夹中： Folder_1 contains file_1 Folder_2 contains file_2 | | | Folder_N c…
MPI通过slurm结合秩与特定节点
我使用 sbatch 来分配具有（比方说）8 个等级的 MPI 作业。 我使用 4 个节点：node0[01-04]。 我想将排名 0 绑定到第一个节点 (node001)，将其他排名…
通过 SLURM 连续运行多个文件，并设置单独的超时
我有一个在 HPC 上运行的 python 脚本，它获取文本文件中的文件列表并启动多个 SBATCH 运行： ./launch_job.sh 0_folder_file_list.txt launch_job.sh…
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