ggplot2 不存在于 python 的 rpy2 中？
我正在 Python3.2 中使用 rpy2 v2.1.9，我不明白为什么我不能使用库 ggplot2 import rpy2 from rpy2.robjects import r r.library("ggplot2") 这是我…
RPy2 robjects.r.pie 给出了奇怪的错误“'x'”值必须为正”
我感觉自己很傻，但我似乎无法解决这个问题。我正在尝试使用 Python 中的 rpy2 制作饼图。 from rpy2.robjects import r import os.path image = "tes…
如何在Python中实现R的p.adjust
我有一个 p 值列表，我想计算 FDR 多重比较的调整 p 值。在 R 中，我可以使用： pval <- read.csv("my_file.txt",header=F,sep="\t") pval <- pval[,1…
RPy2 和 Bioconductor：基因表达示例
我正在尝试弄清楚如何在 Bioconductor 中进行经典基因表达示例使用 Rpy2，我一开始就陷入困境。你如何加载数据？在 R 中，我们这样做： > library('AL…
windows 中的 pickle rpy2 对象
我在 Windows 上使用 rpy2 V2.0.8。我正在使用 rpy2 进行分类，并希望保存（pickle）模型（例如 glm 的输出）。然而，据我所知，V2.0.8不支持pickling…
python程序在没有信息的情况下在pbs中被杀死
我正在 pbs_torque 管理的集群中使用 rpy2 运行一个简单的 Python 程序。我的问题是，同一段代码可以完美地工作，而其他时候则在没有逻辑原因或错误跟…
OSX Lion 上的 rpy2 错误
我已经尝试从源（python setup.py install）和macports安装rpy2（成功终止），并且在尝试导入rpy2时，我收到此错误： /Library/Python/2.7/site-packa…
numpy2ri 与 rpy2 2.2.2 的转换问题
我将 rpy2-2.2.2 与新的免费 Enthought python 发行版一起使用，其中包括 numpy 1.6.0 和 python 2.7.2。我 easy_installed rpy2 导致安装了 v.2.2.2 …
在 os x 10.6 上安装 rpy2 时出错：无法执行 gcc-4.0
我正在尝试使用 pip with: 安装 rpy2 $ sudo pip install rpy2 ，退出时出现错误： gcc-4.0 -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch ppc -a…
rpy2 中的错误 - 没有（非缺失）观察结果
我正在 Ubuntu 1104 上使用 rpy2。我正在遵循 COX 文件。文件中给出的步骤是在 R 中。我必须使用 rpy2 在 python 中执行相同的步骤。 我没有得到任何…
在 Mac OS X 10.6.8 上安装 rpy2 2.2.1 时出错
我正在尝试从下载的源存档“rpy2-2.2.1.tar.gz”安装 rpy2。我一直遵循 rpy2 文档。这就是我正在做的： tar -xzf rpy2-2.2.1.tar.gz cd ~/Desktop/rpy…
在 Windows 上编译 rpy2 需要什么设置？
我已经能够从 Source Forge 的 .msi 安装 rpy2 v2.0.8，但我想使用包含软件包代码的最新版本，即v2.1.9。 我正在尝试在 Windows 中编译 rpy2 (python …
使用 rpy2 访问名称中带有点的函数（例如“as.vector”）
我正在尝试使用 rpy2 从 Python 中访问“as.vector”R 函数。假设，为了简单起见，我想使用 rpy2 （R 代码）做一些简单的事情： x <- as.vector(c(1, …
有人用过 rpy2 和 py2exe 吗？
我希望将一些使用 RPY2 运行 R 函数的 Python 代码移植到使用 py2exe 的 dll 中，然后最终移植到 COM 对象，以便与协作者的 C# 项目集成。 如果将 rpy…
