qsub

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让 qsub 阻塞直到工作完成?

目前,我有一个驱动程序,它运行数千个“有效负载”程序实例,并对输出进行一些后处理。驱动程序当前使用 shell() 函数从多个线程直接调用有效负载程…

阿楠 2024-11-07 05:11:59 0 0

将 Perl 生成的脚本提交到 SGE 时捕获作业 ID

Perl 无法打开同时运行的命令管道,这会导致通过 qsub 提交到 SGE 时出现问题,因为我丢失了提交的作业 ID。如何将生成的脚本提交给 SGE 并捕获 SGE …

本宫微胖 2024-11-03 08:26:55 2 0

SGE - QSUB 无法在同步模式下提交作业

我有一个 perl 脚本,它准备文件以输入到二进制程序,并将二进制程序的执行提交到 SGE 排队系统版本 6.2u2。 使用 -sync y 选项提交作业,以允许父 Pe…

寂寞笑我太脆弱 2024-10-15 11:39:29 3 0

在 GridEngine 集群的多个节点上运行作业

我可以访问一个 128 核集群,我想在该集群上运行并行作业。该集群使用 Sun GridEngine,我的程序编写为在 Python 2.5.8 上使用并行 Python、numpy、sc…

末骤雨初歇 2024-09-26 11:54:54 4 0

以 qsub 启动的 shell 脚本的参数

如何参数化在网格上执行的 shell 脚本(以 qsub 开头)?我有一个 shell 脚本,我使用 getopts 来读取参数。 当我使用 qsub 启动 (qsub script.sh -r …

天气好吗我好吗 2024-09-15 02:30:24 3 0

“令人尴尬地平行”在集群上使用 python 和 PBS 进行编程

我有一个可以生成数字的函数(神经网络模型)。我希望在带有 Torque 的标准集群上使用 PBS 来测试来自 python 的多个参数、方法和不同输入(意味着数…

苦笑流年记忆 2024-09-10 22:26:34 5 0

从 Sun Grid Engine 上使用 qsub 提交的进程获取退出代码

我想通过 Sun Grid Engine(现在:Oracle Grid Engine?)上的 qsub 提交作业。我不想使用 -sync yes 选项或 qrsh,因为我希望我的控制程序是单线程的…

苏辞 2024-09-06 05:13:34 7 0

有人有在 ClusterVisionOS 上运行集群的经验吗?

我目前正在使用 ClusterVisionOS 3.1 开发集群。这将是我第一次使用集群,所以我可能还没有尝试过“显而易见的”。 我可以使用“qsub”命令向集群提交…

场罚期间 2024-08-25 05:56:18 3 0

如何限制同时运行的 PBS 作业的数量

我有一个 64 节点集群,运行 PBS Pro。如果我提交数百个作业,我可以同时运行 64 个作业。这很棒,除非所有 64 个作业恰好都接近 I/O 限制,并且正在…

东京女 2024-08-17 19:42:08 7 0

当我从 Perl 调用 awk 语句时,为什么它不起作用?

我使用 AWK 的以下命令作为独立命令没有问题, 没有任何错误: $ awk '$9 != "NTM" &amp&amp $9 != ""' myfile.txt | less -Sn 但是当我将它们应用于 …

森罗 2024-07-16 09:27:04 5 0
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