如何用xml.etree.elementtree解析XML？
我正在尝试使用 XML.Etree.Elementree 来解析XML，但我无法提取信息“ articletitle” and code>“ descriptorneName” “ descriptorname” >分别将…
解析PubMed数据并从多个文件中提取多个列
我有来自PubMed的多个 XML 文件。多个文件在这里。 如何在单个数据框架中解析并获取这些列。 如果一篇文章有几位作者，我想让它们作为单独的行 预…
NOTXMLERROR：无法解析XML数据
我正在尝试使用来自Biopython的Entrez模块来从PubMed Central检出全文文章。这是我做同样的代码。 import urllib3 import json import requests from …
PubMed提取文章详细信息到Daframe
这是代码。 import pandas as pd from pymed import PubMed import numpy as np pubmed = PubMed(tool="PubMedSearcher", email="[email protected]")…
如何编写 Python 代码从 PubMed 下载摘要？
这是我现在拥有的代码，我尝试了多种不同的方法来获取正确的代码，但无济于事。 我为此使用 Biopython 模块。 from Bio.Entrez import efetch def pri…
在 python3 中从 Pubmed 下载 pdf 时出错
我试图使用 fetch pdf 从 python 中下载 PubMed pdf 代码 mkr5="18368049" os.system('python3 fetch_pdfs.py -pmids$mkr5') 这是我收到此错误的 fetc…
使用 R 通过标题获取 Pubmed 摘要
一段时间以来，我一直在尝试使用其标题来获取 Pubmed 摘要。例如，如果我将以下标题放在 pubmPd 掩码上 @ https://pubmed.ncbi.nlm .nih.gov/： 垂体…
如何使用 BigQuery 访问 PubMed 的数据库
从 BigQuery 访问 google_patents_research.publications 表时，我可以按 top_terms 列过滤结果。本专栏使用 Google 的机器学习算法来搜索专利内…
变换 pmc-id ->下午
是否可以通过 ncbi api 将 pmc-ids（pubmed 中央 id）转换为 pmids（pubmed id）？您可以通过网络表单来完成，但我想使用一个程序 - 当然我总是可以编…
首次调用 C# Web 服务速度缓慢
我正在尝试访问此处提供的 PubMed Web 服务： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/soap/v2.0/DOC/esoap_help.html" ncbi.nlm.nih.gov/entrez/…
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