批处理系统上的 Hadoop 作为用户进程
我了解了 Hadoop-on-Demand，以及 SGE 上的 Hadoop 集成。我的理解是，这需要管理员权限，而我在工作的大型集群上没有管理员权限。管理员们忙得不可开…
如何将扭矩和 html 结合起来，例如 ncbiblast 服务？
我使用 php 将作业提交给 Torque (pbs)，它（torque）生成输出为： “该帐户目前无法使用。” 我认为它引用了运行 httpd(apache) 的帐户 apache是…
运行调用使用 PBS 提交的外部 MPI 程序的并行 Python 线程
我对 python 很陌生，我不确定在分布式集群上实现多线程/多进程代码的最佳方法是什么。 我正在尝试使用 Python 编写一个包装器脚本，该脚本调用使用 P…
PBS脚本的作业执行时间（串行作业）
我试图计算出使用便携式批处理系统 (PBS) 完成的串行作业的执行时间。该信息是否位于“尾声”部分的“资源”下的输出文件 (task.o*) 中？是walltime吗…
我如何找到可用扭矩 PBS 队列的完整列表？
问：如何在“典型”Torque MPI 系统上找到可用的 PBS 队列？ （询问我们的管理员需要 24 小时以上，并且系统会随着不断迁移而变化） （例如，“Std8”…
乌班图 +美国公共广播公司阿帕奇？如何将正在运行的作业列表显示为网站？
是否有插件/包可以显示 PBS 队列的状态信息？我目前正在 PBS 集群的登录节点上运行 apache Web 服务器。我想显示状态信息，并且能够执行最少的查询，…
帮助“你好世界” PBSDSH
我想测试 pbsdsh 在我的系统中是否有效。我使用以下程序 我使用的是带有两个 64 位四核 Intel Xeon（24 个计算节点）的 Linux 服务器， try.sh #!/bin…
使用 PBS 提交 R 作业
我正在使用运行并行 R 的 qsub 提交作业。 目的是让 R 程序在 4 个不同的内核而不是 8 个内核上运行。以下是我在 PBS 文件中的一些设置： #PBS -l nod…
