我在 spack 安装阶段安装 openmpi 软件包时遇到问题,该如何继续?
我在从命令开始的 openmpi 配置和安装阶段遇到问题: spack安装hdf5 用于安装spack。 不断获得以下输出:( [...] No patches needed for openmpi ==>…
为什么节点零不会执行一些写入日志文件的语句
我有一个生产作业,通过 OPENMPI 使用两个节点(0=主节点和 1=从节点),并通过 OPENMP 使用每个节点上的所有线程。 我在master上提交了作业。 作业在…
如何以“串行”方式编译 MPI 应用程序模式(不使用 MPI 编译器)?
这个问题可能听起来有点奇怪...... 想象一下我有一个 MPI 应用程序,但我没有安装 MPI 的系统。 所以我想在不修改源代码的情况下编译没有 MPI 支持的…
内存注册和 Open MPI 的限制
当我运行程序时,我收到来自 Open MPI 的警告: libibverbs: Warning: RLIMIT_MEMLOCK is 32768 bytes. This will severely limit memory registratio…
Mpirun:如何打印一个进程的STDOUT?
运行时, mpirun -n 2 两个进程的 STDOUT 流将合并并由 shell 显示。在这种交错格式中,很难分辨哪条线来自哪个节点。 有没有办法让 mpirun 将一个进…
如何确定套接字/节点本地的 MPI 等级/进程号
假设我使用 MPI 运行一个并行程序。执行命令 mpirun -n 8 -npernode 2 总共启动8个进程。即每个节点 2 个进程,总共 4 个节点。 (OpenMPI 1.5)。其…
#pragma 末尾的隐式屏障
朋友们,我正在尝试学习 openMP 范例。 我使用以下代码来理解#omp for pragma。 int main(void){ int tid; int i; omp_set_num_threads(5); #pragma o…
--with-memory-manager=none 用于 mpi 编译的标志
通常,当我想使用 mpicc 编译源代码时,我使用以下命令: mpicc -o source source.c 但是,我在编译当前源代码时遇到一些问题,一些段错误。我在论坛…
OpenMPI 不允许在任何相应的非阻塞原语之前调用 MPI_Wait?
我的应用程序适用于 LAM/MPI,但使用 OpenMPI 时会崩溃。 下面是我的代码的样子。 void Comm::nonblocking_send( int s_idx , int e_idx ) { MPI_Wait…
如何将 MPI(openMPI 或 MPICH2)与 minGW - GNU gfortran 编译器一起使用
我正在使用 eclipse PTP IDE 开发 MPI 代码,我希望能够在 Windows 上编译 MPI,它似乎提供 c++ 和 c 绑定,但我正在使用 fortran 和 gfortran 编译器…
MPI_Allgather 产生不一致的结果
我在一个大型软件的一部分中遇到了 MPI_Allgather 问题。 下面的函数传递了每个节点上不同的双精度和相关标志,然后该函数应该找到全局最小双精度,并…
mpi4py 在 Mac 中的安装
我正在尝试在 mac 上安装 mpi4py,但遇到以下错误: 搜索 mpi4py Best match: mpi4py 1.2.2 Downloading http://mpi4py.googlecode.com/files/mpi4py-…
MPI_Barrier 无法正常工作
我编写了下面的 C 应用程序来帮助我理解 MPI,以及为什么 MPI_Barrier() 在我庞大的 C++ 应用程序中不起作用。然而,我能够用一个小得多的 C 应用程序…