使用 SimpleXML 解释 BLAST XML 输出——连字符问题？嵌套对象访问语法问题？
我正在尝试使用 SimpleXML 读取一些 NCBI BLAST XML 输出，并且我能够访问部分输出，但不能访问其中的其他部分。 这是 XML 的相关部分（为了可读性而…
获取 BLAST 结果的前 10 个序列 Bio Python
我想获得 BLAST 结果的前 10 个序列（只是序列，没有比对或分数或 e 值等）。我正在输入一个包含 5 个 fasta 文件的文本文件。所以我的输出应该是每个…
有人用过pubchemdb吗？有类似的API吗？
更新：答案中的链接既有趣又有用，但不幸的是没有解决对 java API 的需求，所以我仍然期待任何输入。 我正在构建一个化学数据库化合物。我需要所有同…
如何设置 QNetworkReply 属性以获得正确的 NCBI 页面？
我尝试使用 downloadURL 函数获取以下网址，如下所示： http://www. ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/27884304 但是数据并不是我们通过浏览器看到的那样，现…
如何从 XML NCBI BLAST 文件中提取第一个命中元素？
我试图从 NCBI xml BLAST 文件中仅提取第一个命中。接下来我只想得到第一个HSP。在最后阶段，我想根据最好成绩获得这些。 为了清楚起见，这里提供了 x…
在 NCBI c++ 中设置版本号工具包应用程序
如何在 NCBI C++ Toolkit 应用程序中设置版本号？ 我的意思是当我使用参数 -version 启动程序时显示的版本号。 我通读了文档，但还没有找到。 （我知…
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