与slurm和奇异性不一致的行为不一致
我是使用Slurm向HPC提交工作的新手,并且面临一个我无法解决的特殊问题。 我有一个job.slurm文件,其中包含以下bash脚本 #!/bin/bash #SBATCH --job-n…
并行化C++使用MPI_SEND和MPI_RECV代码
我有一个并行的代码,但是我不明白它是否并行工作。 我有两个向量A和B,其元素是按适当类定义的矩阵。 由于向量中的矩阵不是原始类型,因此我无法通过…
收集Python MPI中的结构列表?
我目前正在尝试传达struct对象的列表,但我遇到了一个错误: Traceback (most recent call last): File "Primary_secondary_co-sim.py", line 509, in…
Slurm可以执行SRUN
Slurm无法 srun -n 1 /home/user/share/test/hello.o 运行 rpi40000:0 of 1 ,但是 srun -n 2 /home/user/share/test/hello.o 错误。 srun:错误:sl…
为什么在计算矩阵/多维阵列的FFT时需要计算转置?
我目前正在研究一个问题,该问题涉及使用与MPI结合使用。 根据 1,2,3 4,5,6 7,8,9 我们决定使用三个进程进行计算的FFT,每个过程都将获得此矩阵的一部…
#dask本地流产成功完成之前完成
我运行的命令如下。 mpirun --hostfile /home/user/share/hostlist.txt -np 4 /home/user/share/mpi-dask/venv/bin/dask-mpi --scheduler-file ~/dask…
mpi4py仅获得一个MPI流程可用
我试图使用MPI4PY,但是在尝试初始化它时会遇到以下错误: 尝试创建一个MPI池,但是只有一个MPI流程可用。至少需要两个。 mpi.comm_world.get_size(…
(c)MPI流程在循环后无法做出响应
假设我有一个代码块,该代码块试图计算斐波那契序列中的前15个数字,并使用for循环在3个过程(mpi_send)之间分配每个唯一数字,如下所示。 int main(…
我怎么知道我是否使用MPI(MPICH)运行制造商?
我正在运行制造商来注释基因组。但是我以前没有使用MPI运行制造商,因此速度很低。过去22天的300MB基因组,仍在运行。 我阅读了制造商的手册,它说了M…
了解mpi_irsend()的功能
根据此文档页面: https://www.rookiehpc.com/mpi/docs/mpi_irsend.php#:~: text = definition,bovirst = “实际上,MPI_IRSEND要求首先发出相应的接…