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与slurm和奇异性不一致的行为不一致

我是使用Slurm向HPC提交工作的新手,并且面临一个我无法解决的特殊问题。 我有一个job.slurm文件,其中包含以下bash脚本 #!/bin/bash #SBATCH --job-n…

岁月如刀 2025-02-13 01:50:47 2 0

单独分配MPI CPU

我有一个在 2 MPI进程上运行的代码,每个代码都使用带有OpenMP的多个线程。我的计算机(ubuntu)具有 4 cpu(内核?)。因此,我制作了一个小脚本以给…

可爱咩 2025-02-12 20:24:27 0 0

MPI将大量数据发送给自我

我尝试使用MPI发送并接收一个大型阵列。该代码适用于小阵列(阵列尺寸< 10000)时,当我将阵列大小进一步增加到100000时,它将死去。 Here is my …

眉目亦如画i 2025-02-12 02:58:33 0 0

分配MPI过程来求解矩阵的组件

问题: 我具有一个C代码功能,该功能可以使用Cramer的规则求解任何NXN矩阵。我起草了代码,并正确计算了几个解决方案而没有错误。我想扩大此代码以利…

你丑哭了我 2025-02-11 23:12:52 0 0

并行化C++使用MPI_SEND和MPI_RECV代码

我有一个并行的代码,但是我不明白它是否并行工作。 我有两个向量A和B,其元素是按适当类定义的矩阵。 由于向量中的矩阵不是原始类型,因此我无法通过…

清秋悲枫 2025-02-11 16:54:57 1 0

收集Python MPI中的结构列表?

我目前正在尝试传达struct对象的列表,但我遇到了一个错误: Traceback (most recent call last): File "Primary_secondary_co-sim.py", line 509, in…

风柔一江水 2025-02-10 19:10:56 1 0

Slurm可以执行SRUN

Slurm无法 srun -n 1 /home/user/share/test/hello.o 运行 rpi40000:0 of 1 ,但是 srun -n 2 /home/user/share/test/hello.o 错误。 srun:错误:sl…

一向肩并 2025-02-10 16:28:18 2 0

为什么在计算矩阵/多维阵列的FFT时需要计算转置?

我目前正在研究一个问题,该问题涉及使用与MPI结合使用。 根据 1,2,3 4,5,6 7,8,9 我们决定使用三个进程进行计算的FFT,每个过程都将获得此矩阵的一部…

仅此而已 2025-02-10 05:13:12 1 0

#dask本地流产成功完成之前完成

我运行的命令如下。 mpirun --hostfile /home/user/share/hostlist.txt -np 4 /home/user/share/mpi-dask/venv/bin/dask-mpi --scheduler-file ~/dask…

千年*琉璃梦 2025-02-09 21:18:30 0 0

mpi4py仅获得一个MPI流程可用

我试图使用MPI4PY,但是在尝试初始化它时会遇到以下错误: 尝试创建一个MPI池,但是只有一个MPI流程可用。至少需要两个。 mpi.comm_world.get_size(…

寄风 2025-02-09 12:35:51 1 0

与单个域相比

我想知道,当涉及到5个模板之间的域分解方案时,是否存在任何数值准确性牺牲,东,东北,西北,东南和西南)模型。这些方案是否会对未分解的域方案(…

花心好男孩 2025-02-09 09:58:32 0 0

(c)MPI流程在循环后无法做出响应

假设我有一个代码块,该代码块试图计算斐波那契序列中的前15个数字,并使用for循环在3个过程(mpi_send)之间分配每个唯一数字,如下所示。 int main(…

没有心的人 2025-02-08 13:33:46 0 0

我怎么知道我是否使用MPI(MPICH)运行制造商?

我正在运行制造商来注释基因组。但是我以前没有使用MPI运行制造商,因此速度很低。过去22天的300MB基因组,仍在运行。 我阅读了制造商的手册,它说了M…

放手` 2025-02-07 15:57:37 2 0

了解mpi_irsend()的功能

根据此文档页面: https://www.rookiehpc.com/mpi/docs/mpi_irsend.php#:~: text = definition,bovirst = “实际上,MPI_IRSEND要求首先发出相应的接…

游魂 2025-02-07 07:56:55 0 0

MPI_WAITALL和非阻止接收无效

我获得了一个0xc0000005错误代码等待等级的所有接收!= 0进程。即时消息,请从!= 0进程发送一个封锁发送,并希望在for循环中为每个过程接收它们。稍…

幻梦 2025-02-06 14:21:01 2 0
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