ImageJ

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在批处理过程中保存单个结果和掩盖

当我使用ImageJ fiji中的宏运行批处理过程时,它不会为每个图像分别保存结果表,以图像命名,它用相同(第一个)掩码(图像)覆盖蒙版(处理的图像)…

揽月 2025-02-01 10:07:05 1 0

ij.getVersion()为2.5.0/intactive

我想在jupyter笔记本上使用imagej软件包。我成功完成了所需的安装,但是当我运行时, ij.getVersion() 我会获得2.5.0/不活动,因此无法进行。你能帮忙…

疑心病 2025-01-31 15:50:40 1 0

如何保存来自用户的斐济(imagej)中的构造信息(坐标)

我在斐济有一个宏,我正在使用Waitforuser(“用于创建图”,“沿着单元格的直径制作一条线,然后按OK”)代码,我想保存用户绘制的行坐标,有人可以…

非要怀念 2025-01-29 22:50:48 2 0

格式不支持或找不到读取器插件,fiji imagej

我刚刚在Linux上下载了fiji 64位用于可视化 ome.tif文件。我没有修改任何设置,但无法打开文件。 我会遇到错误“不支持格式或找不到读取器插件”。控…

梦行七里 2025-01-25 21:46:31 2 0

使用BioFormat读/写重组

我需要使用 tiff 格式的大型图像,因此我需要使用 bigtiff 格式。我尝试使用 BioFormats ( BioFormats_package.jar )最后一个版本读取图像, ImageP…

风情万种。 2025-01-25 07:39:05 3 0

试图在imagej中创建马赛克,我得到了这个Java错误

我正在尝试使用斐济(ImageJ)中的Mosaicj插件缝制图像,但是,我在下面的代码中获取错误。有人知道这意味着什么,我如何解决这个问题?我根本没有使…

秋日私语 2025-01-21 01:45:06 3 0

如何访问在 ImageJ 中但在 Python 中看到的 .tif 元数据?

我将显微镜实验中的 .tif 文件加载到 ImageJ 中,它告诉我显微镜视野的尺寸(424.27x424.27 微米)。要在 ImageJ 中访问此数据,我转到“图像”选项卡…

断爱 2025-01-20 04:27:31 4 0

ImageJ/Fiji-使用宏保存CSV

我不是编码器,而是试图将雷暴的批处理过程变成一个自动化的过程,其中我有一个单个输入文件夹和一个单个输出文件夹。 input_directory = newArray("C…

白首有我共你 2025-01-19 02:44:57 5 0

SimpleITK.Show() 在 Macbook 上的 ImageJ 中生成错误

我在Jupyter上与ImageJ斗争。这是我正在运行的代码的一部分: def ImageGen(a,b,x_0,y_0, sigma_x, sigma_y, theta ): g=GaussianFunc(x_0,y_0,sigma_…

逆蝶 2025-01-18 08:05:31 2 0

如何检测二值图像中的不规则物体?

我有嵌入聚合物基质内的纤维的二元显微镜图像,我需要将图像分割成纤维和基质以获得纤维含量。 我尝试了 fill_holes,但它没有获得所有纤维。 fill_ho…

殤城〤 2025-01-16 07:59:10 2 0

使用 imageJ 库扫描 .tiff 图像的像素

我使用 imageJ 库读取 .tiff 图像文件。但是当我尝试读取变量 c 中 image1 的像素时,我收到一条错误消息“不兼容的类型:需要 int,找到 int[]。 我…

末骤雨初歇 2025-01-03 12:16:52 4 0

从 Mathematica 调用 ImageJ

从 Mathematica,我希望将图像传递到 ImageJ 插件,并将结果从 ImageJ 发送到 Mathematica。 JLink 是一个可以提供帮助的工具,但我既不熟悉它,也不…

携君以终年 2025-01-01 10:09:01 5 0

视频图像处理,我该怎么办?

情况是这样的。 我有一个视频,其中包含一些移动的物体(更准确地说是收缩), 我正在尝试编写一个代码来计算这些运动 的运动频率(每分钟收缩多少次…

童话里做英雄 2024-12-25 21:35:06 4 0

ImageJ 亮度和亮度一堆图像的对比

我正在查看 ImageJ 中的图像数据集(一堆 .tif 图像,大约 130 帧),并且该数据集有问题。这是一系列显微镜图像,每一帧都是一个比前一帧高/低约 3-4…

往事随风而去 2024-10-07 20:07:42 17 0

在 ImageJ(java) 中将 String 作为代码执行

代码在String中,例如: String str = "IJ.run(\"FJ Edges\", \"\");"; 如果执行str,就会运行相应的内容。…

泪眸﹌ 2024-09-16 06:58:12 12 0
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