使用BioFormat读/写重组
我需要使用 tiff 格式的大型图像,因此我需要使用 bigtiff 格式。我尝试使用 BioFormats ( BioFormats_package.jar )最后一个版本读取图像, ImageP…
试图在imagej中创建马赛克,我得到了这个Java错误
我正在尝试使用斐济(ImageJ)中的Mosaicj插件缝制图像,但是,我在下面的代码中获取错误。有人知道这意味着什么,我如何解决这个问题?我根本没有使…
如何访问在 ImageJ 中但在 Python 中看到的 .tif 元数据?
我将显微镜实验中的 .tif 文件加载到 ImageJ 中,它告诉我显微镜视野的尺寸(424.27x424.27 微米)。要在 ImageJ 中访问此数据,我转到“图像”选项卡…
ImageJ/Fiji-使用宏保存CSV
我不是编码器,而是试图将雷暴的批处理过程变成一个自动化的过程,其中我有一个单个输入文件夹和一个单个输出文件夹。 input_directory = newArray("C…
SimpleITK.Show() 在 Macbook 上的 ImageJ 中生成错误
我在Jupyter上与ImageJ斗争。这是我正在运行的代码的一部分: def ImageGen(a,b,x_0,y_0, sigma_x, sigma_y, theta ): g=GaussianFunc(x_0,y_0,sigma_…
使用 imageJ 库扫描 .tiff 图像的像素
我使用 imageJ 库读取 .tiff 图像文件。但是当我尝试读取变量 c 中 image1 的像素时,我收到一条错误消息“不兼容的类型:需要 int,找到 int[]。 我…
从 Mathematica 调用 ImageJ
从 Mathematica,我希望将图像传递到 ImageJ 插件,并将结果从 ImageJ 发送到 Mathematica。 JLink 是一个可以提供帮助的工具,但我既不熟悉它,也不…
ImageJ 亮度和亮度一堆图像的对比
我正在查看 ImageJ 中的图像数据集(一堆 .tif 图像,大约 130 帧),并且该数据集有问题。这是一系列显微镜图像,每一帧都是一个比前一帧高/低约 3-4…
在 ImageJ(java) 中将 String 作为代码执行
代码在String中,例如: String str = "IJ.run(\"FJ Edges\", \"\");"; 如果执行str,就会运行相应的内容。…
ImageJ 中多种颜色的叠加
我正在为 imageJ 编写一个小插件,并且正在绘制几个区域作为图像上的叠加层。 我正在使用以下代码: ImagePlus imp = getImage(); Overlay ov = new O…
如何使用 Java 或 clojure 中的 ImageJ 进行批量图像处理?
我想使用 ImageJ 对几千张图像进行一些处理。 有没有办法采用任何通用 imageJ 插件并将其自动应用于数百张图像? 例如,假设我想拍摄一千张图像并对每…
FFT 应用图像的带通滤波器。 (类似ImageJ带通滤波器算法)
我需要一个很好的功能,它是在Java程序中实现的:ImageJ。 我需要了解那里使用的算法。 该函数有几个参数: 链接文本 在使用 FFT 之前,它将图像转换…
保存和访问大量 ROI 多边形(IDL、ImageJ、Java?、XML?)
我需要在一堆图像上保存并重新加载数千个 ROI 多边形,实际上是一部每秒 30 帧的电影,持续 30 多分钟,因此至少有 54,000 帧。堆栈中的单个图像(帧…
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