ImageJ

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使用BioFormat读/写重组

我需要使用 tiff 格式的大型图像,因此我需要使用 bigtiff 格式。我尝试使用 BioFormats ( BioFormats_package.jar )最后一个版本读取图像, ImageP…

风情万种。 2025-01-25 07:39:05 0 0

试图在imagej中创建马赛克,我得到了这个Java错误

我正在尝试使用斐济(ImageJ)中的Mosaicj插件缝制图像,但是,我在下面的代码中获取错误。有人知道这意味着什么,我如何解决这个问题?我根本没有使…

秋日私语 2025-01-21 01:45:06 0 0

如何访问在 ImageJ 中但在 Python 中看到的 .tif 元数据?

我将显微镜实验中的 .tif 文件加载到 ImageJ 中,它告诉我显微镜视野的尺寸(424.27x424.27 微米)。要在 ImageJ 中访问此数据,我转到“图像”选项卡…

断爱 2025-01-20 04:27:31 0 0

ImageJ/Fiji-使用宏保存CSV

我不是编码器,而是试图将雷暴的批处理过程变成一个自动化的过程,其中我有一个单个输入文件夹和一个单个输出文件夹。 input_directory = newArray("C…

白首有我共你 2025-01-19 02:44:57 0 0

SimpleITK.Show() 在 Macbook 上的 ImageJ 中生成错误

我在Jupyter上与ImageJ斗争。这是我正在运行的代码的一部分: def ImageGen(a,b,x_0,y_0, sigma_x, sigma_y, theta ): g=GaussianFunc(x_0,y_0,sigma_…

逆蝶 2025-01-18 08:05:31 0 0

如何检测二值图像中的不规则物体?

我有嵌入聚合物基质内的纤维的二元显微镜图像,我需要将图像分割成纤维和基质以获得纤维含量。 我尝试了 fill_holes,但它没有获得所有纤维。 fill_ho…

殤城〤 2025-01-16 07:59:10 1 0

使用 imageJ 库扫描 .tiff 图像的像素

我使用 imageJ 库读取 .tiff 图像文件。但是当我尝试读取变量 c 中 image1 的像素时,我收到一条错误消息“不兼容的类型:需要 int,找到 int[]。 我…

末骤雨初歇 2025-01-03 12:16:52 3 0

从 Mathematica 调用 ImageJ

从 Mathematica,我希望将图像传递到 ImageJ 插件,并将结果从 ImageJ 发送到 Mathematica。 JLink 是一个可以提供帮助的工具,但我既不熟悉它,也不…

携君以终年 2025-01-01 10:09:01 3 0

视频图像处理,我该怎么办?

情况是这样的。 我有一个视频,其中包含一些移动的物体(更准确地说是收缩), 我正在尝试编写一个代码来计算这些运动 的运动频率(每分钟收缩多少次…

童话里做英雄 2024-12-25 21:35:06 3 0

ImageJ 亮度和亮度一堆图像的对比

我正在查看 ImageJ 中的图像数据集(一堆 .tif 图像,大约 130 帧),并且该数据集有问题。这是一系列显微镜图像,每一帧都是一个比前一帧高/低约 3-4…

往事随风而去 2024-10-07 20:07:42 12 0

在 ImageJ(java) 中将 String 作为代码执行

代码在String中,例如: String str = "IJ.run(\"FJ Edges\", \"\");"; 如果执行str,就会运行相应的内容。…

泪眸﹌ 2024-09-16 06:58:12 9 0

ImageJ 中多种颜色的叠加

我正在为 imageJ 编写一个小插件,并且正在绘制几个区域作为图像上的叠加层。 我正在使用以下代码: ImagePlus imp = getImage(); Overlay ov = new O…

青萝楚歌 2024-09-04 01:21:34 9 0

如何使用 Java 或 clojure 中的 ImageJ 进行批量图像处理?

我想使用 ImageJ 对几千张图像进行一些处理。 有没有办法采用任何通用 imageJ 插件并将其自动应用于数百张图像? 例如,假设我想拍摄一千张图像并对每…

世界和平 2024-08-31 04:32:06 10 0

FFT 应用图像的带通滤波器。 (类似ImageJ带通滤波器算法)

我需要一个很好的功能,它是在Java程序中实现的:ImageJ。 我需要了解那里使用的算法。 该函数有几个参数: 链接文本 在使用 FFT 之前,它将图像转换…

蘸点软妹酱 2024-08-27 21:59:04 13 0

保存和访问大量 ROI 多边形(IDL、ImageJ、Java?、XML?)

我需要在一堆图像上保存并重新加载数千个 ROI 多边形,实际上是一部每秒 30 帧的电影,持续 30 多分钟,因此至少有 54,000 帧。堆栈中的单个图像(帧…

找回味觉 2024-08-23 14:53:12 18 0
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