“读入”通过 PyTables 或 PyHDF 将大文本文件导入 hdf5?
我正在尝试使用 SciPy 进行一些统计,但我的输入数据集非常大(~1.9GB)并且采用 dbf 格式。 该文件足够大,以至于当我尝试使用 genfromtxt 创建数组…
Mathematica HDF5 和复合数组
有人在 Mathematica 中有解决方法来读取 HDF5 复合数组吗?我在表中有一个简单的 2D 复合类型(int/float),但它目前被忽略。 HDF5 类型的示例可能是…
将 2 个 hdf5 文件与 pytables 合并
ptrepack 几乎是我想要的,只是它只有覆盖或忽略的选项重复的路径。下面的示例说明了我希望使用结构发生什么 输入文件一个 / (RootGroup) '' /data_se…
HDF5:存储 NumPy 数据
当我使用 NumPy 时,我以本机格式 *.npy 存储它的数据。它非常快,给了我一些好处,比如 我可以从 C 代码中读取 *.npy 简单的二进制数据(我的意思是 …
HDF5内部数据组织和NumPy使用
正如 hdf5 文档所述,HDF5 使用 NumPy 存储数据 “它构建在 HDF5 库、Python 语言和 NumPy 包之上。它具有面向对象的接口,与 C 扩展相结合,可满足性…
Google Protocol Buffers、HDF5、NumPy 比较(传输数据)
我需要帮助才能做出决定。我需要在我的应用程序中传输一些数据,并且必须在这 3 种技术之间做出选择。 我已经阅读了一些有关所有技术的内容(教程、文…
如何在现有 HDF5 文件上创建组? (HDF5)
我有一个用 C++ 编写的第三方实用程序,它创建带有单个数据组的 HDF5 文件。 我想导入两个 H5 文件,每个文件都有一个唯一的数据组,并输出一个包含两…
BadImageFormatException:带有 hdf5dll.dll 的 PInvoke ImportDll
好的,我从官方网站下载了 HDF5 库,还有一些 DLL,包括 hdf5dll.dll 和 hdf5_hldll.dll。 我认为在我的类 H5、H5LT、H5F 和 H5T< 中,有一些围绕本…
在configure中找到底层编译器
我有一个使用编译器包装器编译的应用程序,例如 h5fc/h5cc(HDF5 编译器包装器)或 mpif90/mpicc(MPI 编译器包装器)。这些只是包装器,可以使用 -sh…
将 h5py 数据集输出到文本的快速方法是什么?
我正在使用 h5py python 包来读取 HDF5 格式的文件。 (例如somefile.h5) 我想将数据集的内容写入文本文件。 例如,我想创建一个包含以下内容的文本…
HDF5 .Net 包装器
我得到( http://www.hdfgroup.org/projects/hdf.net/ ) 指定的模块不能 成立。 (HRESULT 的异常: 0x8007007E) 从依赖项步行器中我发现 SZLIBDLL.D…
在 Mac OS X 10.6.3 中安装 h5py
我正在尝试在 Mac OS X 10.6.3 中安装 h5py。 首先我安装了HDF5 1.8,它使用了以下命令: ./configure \ --prefix=/Library/Frameworks/Python.framew…
matlab mex 文件的共享库位置:
我正在尝试编写一个使用 libhdf5 的 matlab mex 函数;我的 Linux 安装提供了 libhdf5-1.8 共享库和标头。然而,我的 Matlab 版本 r2007b 提供了 1.6 …
Python、PyTables、Java - 将它们结合在一起
简而言之问题 What is the best way to get Python and Java to play nice with each other? 更详细的解释 我的情况有些复杂。我会尽力用图片和文字来…
R 和 HDF5 问题
我正在尝试将 hdf5 加载到 R 中并遇到一些问题。以下是我配置环境所采取的步骤: 上的 R 2.10.0 (x64) Mac OS X 10.6 hdf5 1.8.3 通过来自 CRAN 的 ma…