hclust

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heatmap.2中设置距离矩阵和聚类方法

heatmap.2 默认使用 dist 计算距离矩阵,使用 hclust 进行聚类。 现在有人知道如何设置 dist 使用欧几里德方法和 hclust 使用质心方法吗? 我在下面提…

只有影子陪我不离不弃 2024-11-26 07:29:24 3 0

hclust 函数的聚类列表

使用plot(hclust(dist(x)))方法,我能够绘制聚类树图。有用。然而我想获得所有集群的列表,而不是树形图,因为我有大量数据(例如 150K 个节点)并且…

王权女流氓 2024-11-17 19:18:27 4 0

共识树或“引导比例”来自多个 hclust 对象

我有一个由一个变量的微小变化(用于计算距离矩阵)产生的 hclust 对象列表, 现在我想从这个列表中创建一个共识树。 有通用包可以做到这一点吗?我正…

热风软妹 2024-08-09 02:29:30 11 0

如何在 R 树形图中正确着色边缘或绘制矩形?

我使用 R 的 hclust() 生成了此树状图 、 as.dendrogram() 和 plot.dendrogram() 函数。 我使用了dendrapply()函数和一个本地函数来给叶子着色,效果…

往事随风而去 2024-07-16 22:22:45 14 0
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