如何将BAM转换为管道中的FASTQ进行分析，然后删除生成的FASTQ？
抱歉，这个问题，但我是一个没有太多编程经验的生物信息学家，我不知道该如何解决。 我在服务器目录中有几个BAM文件。我想用 grep 在BAM和CorrisPondi…
GREP从命令DF -H斜线开始
我想在我的pod kubernetes上运行命令df -h，并与GREP提取一行，但行不通： $ df -h Filesystem Size Used Available Use% Mounted on overlay 249.9G …
为什么＆＃x27;＆＃x27; grep [ff] irst *.txt＆＃x27;＆＃x27;不匹配包含“首先”的文件？
孟德尔·库珀（Mendel Cooper）的“高级bash施法指南”中的示例... $bash --version | head -1 GNU bash, version 5.0.17(1)-release (x86_64-pc-linux…
grep命令查找相同的数字
我正在寻找的是找到一个GREP命令，以4位数字序列找到相同的数字。 例如， 1111 1234 5678 1231 2233 4546 应该 1111 1231 2233 4546 尝试输出 GREP“ …
如何编写shell脚本以在特定单词之后选择任何单词
我正在尝试编写Shell脚本以在Jenkins管道日志文件中找到批准的用户。我在这里放了管道脚本的一部分。如何选择“ mpportal管理员”或以“通过”单词批…
Linux查找Xargs命令GREP显示路径和文件名
查找/文件夹/202205 ??/-Type f | Xargs Head -50 | GREP'^starting' 有20220501 20220502 20220503，依此类推... 此命令搜索“/文件夹/202205 ??/'中…
将logcat打印到使用过滤器的文件？使用GREP？
我很容易通过这样做来打印我的logcat以提交文件： Process process = Runtime.getRuntime().exec( "logcat -f test.txt"); 但是我想根据匹配的单词过…
使用GREP/SED/等提取括号？
我正在尝试使用以下管道命令来获取PHP-FPM的文件位置： ps aux | grep php-fpm | grep master 结果： root 80 0.0 0.6 334912 26072 ? Ss 14:18 0:00 …
使用终端和正则表达式从.txt文件中选择变量名称
我正在尝试仅使用变量的名称制作文件： 我正在使用天然表达式和bash终端。 Main .TXT文件具有以下内容： " 1. symboling: -3, -2, -1, 0, 1, 2, 3. 2.…
Linux搜索字符串在带有空间的文件中
我试图弄清楚如何在Linux中搜索字符串，希望有人可以帮助我。 grep "Test\|Account" test.txt 如果我只想搜索一个单词，则上述命令有效。 但是，当我…
shell脚本grep命令-c（count） - 命令行排序是否重要？
只是一个关于疑问的快速问题。这两个区别有什么区别： grep "$genre" "$i" | grep "$type" -c 他们也许 grep "$genre" "$i" | grep -c "$type" 做同样…
如何根据另一个文件中的常见信息在文件中提取行？
我的文件看起来像：file1： 8189157 7423700 7227471 8189199 7533538 7574425 8189200 7533538 7574425 8189273 7241932 7538338 8191298 6353935 67…
