调整Fucntion以找到一个以上的位置
我创建了此功能，并在DNA序列中找到了基础的位置。像dna = ['a'，'g'，'c'，'g'，'t'，'a'，'g'，'t'，'t'，'c'，'g'，a'，'t '，'c'，'a'，'a'，'t'…
如何将文件/目录加载到mobaxterm中以启动拖拉机（用于遗传学）操作？
拖拉机是一个为混合个体增加GWAS的操作。有在线教程，但我甚至在MobaxTerm开始运行拖拉机。每当我尝试运行一些代码时，我都会回到“无法打开文件 - 任…
ieugwasr :: ld_matrix无法提取LD矩阵
我希望使用ieugwasr :: ld_matrix提取LD矩阵。但是，我无法这样做，因为ld_matrix不会将.bim文件写入我的TMP文件夹。可重现的示例如下： variants <- …
子集Plink二进制文件（床，BIM＆amp; fam）
大家好，我正在研究基因型数据，我有GWAS的摘要统计信息，我有床，BIM和FAM文件。因为个人的数量很多，所以我想从我的二进制文件中以3000个随机的数量…
plink 的地图文件输出存在问题
我正在使用VCF文件（使用BCFTools生成），以使用PLINK软件创建地图文件。我正在使用的命令是 ./plink --vcf sample.vcf --out sample --recode --allo…
Python 调用多个 URL 并从中提取数据
我正在尝试编写一个调用网页的脚本（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=7742&lvl=3&lin =f&keep=1&srchmode=1&u…
SQLite - 是否有 rtree 的替代方案来在轴上索引线？
我正在尝试创建一个具有起点和终点的位置数据库：基本上是一维轴上的线。我想有效地查询与给定间隔重叠的所有位置。在传统表中，查询需要两个不等式，…
原生 Python 中的 DNA 序列比对（无 biopython）
我有一个有趣的遗传学问题，我想用原生 Python 来解决（没有标准库之外的东西）。这是为了使该解决方案能够非常容易地在任何计算机上使用，而不需要用…
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