dendrogram

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如何修改 MATLAB 系统发育树工具中的轴?

我想为我在 Java 中生成的一些聚集集群显示漂亮的树状图。我将簇写入 Newick 格式的文件中。然后,我就可以得到一张几乎是我想要的漂亮照片。 tr = ph…

来日方长 2024-11-06 21:40:42 0 0

scipy-cluster 定制生成的树状图

这是scipy-cluster生成的树状图不显示的后续内容。 from matplotlib.pyplot import show from scipy.spatial.distance import pdist from scipy.clust…

桃扇骨 2024-10-27 04:58:16 1 0

如何使用 Python 创建非 ASCII 树形图?

尝试使用找到的代码块创建树状图,它会一直工作直到调用: r('mt_dist &lt- dist(t(mt))') 然后抛出错误: RPy_RException:dist(t(mt)) 中的错误:无…

初心未许 2024-10-19 07:25:28 2 0

如何在 Python 中创建像下面的代码示例那样的径向集群?

我找到了几个关于如何创建这些精确层次结构的示例(至少我相信它们是),如下所示 stackoverflow.com/questions/2982929/ 效果很好,几乎可以执行我正…

尹雨沫 2024-10-18 22:53:37 4 0

scipy-cluster 生成的树状图不显示

我正在使用 scipy-cluster 对某些数据生成层次聚类。作为应用程序的最后一步,我将 dendrogram 函数绘制聚类图。我使用内置的 Python 2.6.1 和 在 Mac…

通知家属抬走 2024-09-04 06:26:46 6 0

在数据矩阵上绘制层次聚类的结果

在Python中,如何在值矩阵的顶部绘制树状图,并适当地重新排序以反映聚类?下图就是一个示例: 这是图 6,来自:一组诱导多能性黑猩猩干细胞:比较功…

世界等同你 2024-09-04 01:16:55 4 0

如何手动创建树状图(或“hclust”)对象? (在 R 中)

我有一个作为图像的树状图。由于它不是很大,我可以“手动”将其构建为 R 对象。 所以我的问题是,当我只有树状图图像时,如何手动创建树状图(或“hc…

与之呼应 2024-08-22 06:24:18 6 0

您如何比较两者的“相似性”?两个树状图之间(在 R 中)?

我有两个树状图,我希望将它们相互比较,以找出它们的“相似性”。但我不知道有什么方法可以做到这一点(更不用说实现它的代码了,比如在 R 中)。 有…

旧人 2024-08-21 03:18:29 4 0

从 R 中的谱系数据生成树状图

有没有办法生成树状图,其中图的每个级别代表一代,并且每个级别仅连接同一父亲的儿子? 我正在尝试使用 R 的 hclust 和绘图函数来生成父子谱系的树状…

舞袖。长 2024-08-20 16:52:12 5 0

在 Java 中嵌入树状图

我正在寻找一个能够在Java中绘制数据树状图的库(不计算它们,我可以自己做)..你有什么线索吗?已经尝试通过谷歌搜索它,但没有找到任何不独立的东西…

甜心 2024-08-20 13:02:10 3 0

共识树或“引导比例”来自多个 hclust 对象

我有一个由一个变量的微小变化(用于计算距离矩阵)产生的 hclust 对象列表, 现在我想从这个列表中创建一个共识树。 有通用包可以做到这一点吗?我正…

热风软妹 2024-08-09 02:29:30 5 0

如何在 R 树形图中正确着色边缘或绘制矩形?

我使用 R 的 hclust() 生成了此树状图 、 as.dendrogram() 和 plot.dendrogram() 函数。 我使用了dendrapply()函数和一个本地函数来给叶子着色,效果…

往事随风而去 2024-07-16 22:22:45 10 0

用于绘制树状图的库或任何 API

我有一个 MySQL 数据库,其中包含一些数据,它与 JSP 页面交互,问题是我必须从数据库中存储的各种文件绘制树状图。 我找到了一些java API,比如JTree…

单挑你×的.吻 2024-07-14 10:29:22 5 0

我应该使用什么组件在 Java 中绘制树状图?

树状图不是常规图。 我应该使用 javax.swing.* 库中的任何组件,还是只使用 java.awt.Graphics 绘制它?…

红衣飘飘貌似仙 2024-07-08 17:53:30 6 0
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