如何修改 MATLAB 系统发育树工具中的轴?
我想为我在 Java 中生成的一些聚集集群显示漂亮的树状图。我将簇写入 Newick 格式的文件中。然后,我就可以得到一张几乎是我想要的漂亮照片。 tr = ph…
scipy-cluster 定制生成的树状图
这是scipy-cluster生成的树状图不显示的后续内容。 from matplotlib.pyplot import show from scipy.spatial.distance import pdist from scipy.clust…
如何使用 Python 创建非 ASCII 树形图?
尝试使用找到的代码块创建树状图,它会一直工作直到调用: r('mt_dist <- dist(t(mt))') 然后抛出错误: RPy_RException:dist(t(mt)) 中的错误:无…
如何在 Python 中创建像下面的代码示例那样的径向集群?
我找到了几个关于如何创建这些精确层次结构的示例(至少我相信它们是),如下所示 stackoverflow.com/questions/2982929/ 效果很好,几乎可以执行我正…
scipy-cluster 生成的树状图不显示
我正在使用 scipy-cluster 对某些数据生成层次聚类。作为应用程序的最后一步,我将 dendrogram 函数绘制聚类图。我使用内置的 Python 2.6.1 和 在 Mac…
如何手动创建树状图(或“hclust”)对象? (在 R 中)
我有一个作为图像的树状图。由于它不是很大,我可以“手动”将其构建为 R 对象。 所以我的问题是,当我只有树状图图像时,如何手动创建树状图(或“hc…
您如何比较两者的“相似性”?两个树状图之间(在 R 中)?
我有两个树状图,我希望将它们相互比较,以找出它们的“相似性”。但我不知道有什么方法可以做到这一点(更不用说实现它的代码了,比如在 R 中)。 有…
共识树或“引导比例”来自多个 hclust 对象
我有一个由一个变量的微小变化(用于计算距离矩阵)产生的 hclust 对象列表, 现在我想从这个列表中创建一个共识树。 有通用包可以做到这一点吗?我正…
如何在 R 树形图中正确着色边缘或绘制矩形?
我使用 R 的 hclust() 生成了此树状图 、 as.dendrogram() 和 plot.dendrogram() 函数。 我使用了dendrapply()函数和一个本地函数来给叶子着色,效果…
用于绘制树状图的库或任何 API
我有一个 MySQL 数据库,其中包含一些数据,它与 JSP 页面交互,问题是我必须从数据库中存储的各种文件绘制树状图。 我找到了一些java API,比如JTree…
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