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R:Circlize_dendRogram():错误 - 并非所有标签都是唯一的。因此,我们用一个运行号码填充标签,以便能够产生该图

问题 我想使用函数 circlize_dendrogram()在 copplize circlize 中产生“风扇”形状的树状图。我想将海豚哨子子类型(请参阅下面的提示标签)组成分…

一身软味 2025-02-08 21:44:29 0 0

更改树状图上的提示标签“ type = fan”基于使用APE软件包中R中的定义组

问题: 我有一个名为 sub_whistle_count (见下文)的数据框架。我正在尝试使用 hclust()进行层次分析,但是我无法自定义正确的标签名称 whistle_ty…

少跟Wǒ拽 2025-02-08 06:40:45 1 0

用实际数据绘制树状图为'高度' r中的树而不是距离

我想从关联矩阵中生成一个树状图(即,一个平方矩阵,其中包含我人群中每对个体的关联数据)。树状图应显示Y轴上的关联指数(比例为0至1),并且作为…

愿与i 2025-01-30 18:41:35 4 0

使用分类法绘制简单的树状图,而无需在R中聚类

我有一个看起来像这样的分类数据集: 我想绘制一个简单的树状图,该模拟图仅显示分类关系,而在哪里宽度或颜色代表数据集中该属的丰度。似乎R中的许多…

笙痞 2025-01-29 19:27:48 4 0

如何在plotly.figure_factory中设置create_dendrogram的distfun

我在 create_dendrogram in plotly.figure_factory 中绘制树状图时遇到一些困难。 默认的linkageFun( linkageFun )是完整,距离函数的默认设置( di…

红玫瑰 2025-01-22 21:41:09 6 0

绘制树状图

我试图用我的数据绘制树状图, dendogram <- hclust(distance) 但遇到了此错误代码。 Error in if (is.na(n) || n > 65536L) stop("size cannot be NA…

漆黑的白昼 2025-01-22 08:30:30 4 0

如何自动化颜色的数量和从树状图聚集层次结构返回的颜色?

scikit-learn 给出 生成树状图的 python 代码示例。我复制/粘贴下面的代码。此代码生成树状图。该树状图显示 3 种不同的颜色:蓝色、绿色和橙色。 问…

拥醉 2025-01-19 01:15:53 5 0

.rect_dendrogram(dend, k = k, Palette = rect_border, rect_fill = rect_fill, 中的错误:k 必须介于 2 和 97 之间

我正在尝试在R中估算R中的簇树状图,以估算我制作的98个主题的结构主题模型。 我首先运行以下效果很好: res.hc <- eclust(scale(out_corr$cor), "hcl…

云仙小弟 2025-01-18 19:13:36 6 0

如何使用同一数据框中另一列的分类变量在 R 中的 hclust 中标记树状图的叶子

我想更改树状图叶子的默认标签,以匹配使用 dplyr group_by 和 summarise 生成的数据框中的分类变量列功能。这是数据框的屏幕截图。 我想使用“m”列…

不甘平庸 2025-01-10 02:31:22 5 0

将 hcluster 生成的 ndarray 转换为 Newick 字符串以与 ete2 包一起使用

我有一个通过运行创建的向量列表: import hcluster import numpy as np from ete2 import Tree vecs = [np.array(i) for i in document_list] 其中 d…

半岛未凉 2025-01-07 17:08:48 4 0

关于树状图函数的返回向量

我正在使用 matlab 函数绘制树状图,如下所示 [h1,t1,perm1] = dendrogram(z,3); 根据 MA​​TLAB 文档,返回的 h1 是树状图中线的句柄向量。我不知道…

肤浅与狂妄 2024-12-19 19:36:08 5 0

用多种颜色标记 ggdendro 叶子

我遇到一种情况,我正在绘制带有类标签的数据点的树状图。 我希望看到凝聚聚类将具有相同标签的那些聚集在一起。对标签进行颜色编码可以轻松阅读此类…

寒尘 2024-12-14 08:18:48 4 0

Matlab 中的凝聚聚类

我有一个简单的二维数据集,我希望以凝聚的方式进行聚类(不知道要使用的最佳聚类数量)。我能够成功对数据进行聚类的唯一方法是为函数指定“maxclust…

江挽川 2024-12-13 22:30:24 7 0

如何在 R 中将树转换为树状图?

如何将树(Java 程序的输出)转换为 R 中的树形图? 目前,我正在使用此处给出的建议将树转换为 Newick 格式.然后我使用 R 中的 ape 包来读取 Newick …

心凉怎暖 2024-12-05 11:18:59 4 0

如何使用大型数据集绘制树状图?

我在 R 中使用 ape(系统发育和进化分析)包,它具有树状图绘制功能。我使用以下命令读取 Newick 格式的数据,并使用绘图函数绘制树状图: library("a…

贱贱哒 2024-12-04 06:25:06 8 0
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