NCBI Blast API 使用 QuickBLASTP 程序
我正在使用 NCBI Blast 的 Web API。在基于浏览器的 Blast 搜索中，他们提供了一个名为 QuickBLASTP 的程序，该程序比常规的blastp 快得多。我如何在…
使用 Python 从 FASTA 制作 Blast 数据库
我该怎么做？我使用 Biopython 并已经看过手册。当然，我可以在独立的 NCBI BLAST+ 中使用“makeblastdb”从 FASTA 制作blastdb，但我想在一个程序中…
解析 XML 文件 VB.NET
我有以下 XML 文件。我想从文件 out.xml 中获取 VB.NET 中标签 HSP 下第一个 Hsp_qseq、Hsp_hseq 和 Hsp_midline 的值 blastn BLASTN 2.2.25+ Zheng Z…
如何在apche2服务器上运行本地blast程序
我正在 apche2 服务器中运行本地blast程序...但它向我显示错误。 --------------------------------- 警告 --------------------- MSG：找不到blastal…
使用 SimpleXML 解释 BLAST XML 输出——连字符问题？嵌套对象访问语法问题？
我正在尝试使用 SimpleXML 读取一些 NCBI BLAST XML 输出，并且我能够访问部分输出，但不能访问其中的其他部分。 这是 XML 的相关部分（为了可读性而…
获取 BLAST 结果的前 10 个序列 Bio Python
我想获得 BLAST 结果的前 10 个序列（只是序列，没有比对或分数或 e 值等）。我正在输入一个包含 5 个 fasta 文件的文本文件。所以我的输出应该是每个…
BLAST对齐算法的Python实现？
Closed. This question is seeking recommendations for software libraries, tutorials, tools, books, or other off-site resources. It does not …
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