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我可以使用 BLAST 比较 2 个非生物字符串吗?

我知道 BLAST(基本局部对齐搜索工具)的设计目的。但我对使用这种高级文本比较及其最终效果感兴趣。…

烟─花易冷 2024-12-08 13:15:23 0 0

使用 SimpleXML 解释 BLAST XML 输出——连字符问题?嵌套对象访问语法问题?

我正在尝试使用 SimpleXML 读取一些 NCBI BLAST XML 输出,并且我能够访问部分输出,但不能访问其中的其他部分。 这是 XML 的相关部分(为了可读性而…

深海蓝天 2024-11-25 10:01:44 1 0

获取 BLAST 结果的前 10 个序列 Bio Python

我想获得 BLAST 结果的前 10 个序列(只是序列,没有比对或分数或 e 值等)。我正在输入一个包含 5 个 fasta 文件的文本文件。所以我的输出应该是每个…

温柔一刀 2024-11-18 05:55:53 5 0

不同的爆炸工具

我目前正在寻找商业与非商业喷砂工具。我曾多次使用 NCBI 爆炸进行本地爆炸搜索,但现在我正在寻找有趣的替代方案。在搜索过程中,我发现了一些有趣的…

仲春光 2024-11-05 07:14:07 3 0

以编程方式获取blastn数据库

在 核苷酸BLAST搜索页面 有没有办法以编程方式获取“选择搜索集”框中列出的数据库? 也许是 XML 格式? (使用的编程语言并不重要)…

眼睛会笑 2024-09-19 11:14:27 11 0

BLAST对齐算法的Python实现?

Closed. This question is seeking recommendations for software libraries, tutorials, tools, books, or other off-site resources. It does not …

花之痕靓丽 2024-09-14 10:07:10 10 0

通过 XGrid 运行 BLAST

有人有使用 XGrid 运行 BLAST 的经验吗? 谷歌搜索显示存在一个名为“Xgrid BLAST”的工具,但不知道在哪里可以找到。…

冷了相思 2024-08-23 00:18:07 10 0

使用 BioPython 运行 BLAST 查询

我想对 几个序列进行 BLAST 从每个查询中检索前 100 个命中左右 池化下载的序列 删除重复项 我如何在 BioPython 中执行此操作?…

秉烛思 2024-08-10 02:17:23 16 0
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