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Perl 中的 Bioperl 测试错误

这里是新手,我正在尝试在 perl 环境中使用 Bioperl 模块。我的配置是 Windows Vista/32 Active Perl 5.10.1 Bioperl 1.6.1 Padre 和 Per Studio 2010…

回忆追雨的时光 2024-10-12 11:05:13 1 0

使用 perl 脚本编辑帮助以在数组中的特定位置启动和停止

寻找故障排除和编辑帮助。这是一项家庭作业。我的教授鼓励使用论坛。我还没有 Perl 函数或 Subs 的经验,所以请将回复限制在适当的水平,以便我能够理…

少女的英雄梦 2024-10-01 11:09:10 5 0

在 Mac 上从 CPAN 中删除 Perl 模块

据我所知,需要在 Mac 上使用 sudo 运行 CPAN sudo perl -MCPAN -e shell 才能安装新模块。理论上,可以通过从 Perl 文件夹中删除模块来删除该模块。 …

审判长 2024-09-29 19:12:40 2 0

我如何解决这个与 BioPerl 相关的谜团?

我正在使用 Ubuntu 10.04 和 Perl 5.10.1。 BioPerl 软件包有一些不错的脚本,例如 bp_genbank2gff3.pl,它将文件从 genbank 格式转换为 GFF3 格式。 …

末蓝 2024-09-24 07:34:59 2 0

为什么 Eclipse 无法识别 $PERL5LIB?

我遵循 BioPerl 手册:我克隆了 bioperl-live 在 ~/src 下,然后将以下行添加到我的 ~/.profile (我使用的是 Ubuntu): export PERL5LIB="$HOME/src…

不再让梦枯萎 2024-09-19 13:24:21 2 0

Bioperl 是否有相当于 Seq 对象数组的 IO::ScalarArray ?

在 Perl 中,我们有 IO:: ScalarArray 用于将数组的元素视为文件的行。在 BioPerl 中,我们有 Bio::SeqIO&lt /code&gt,它可以生成一个文件句柄来读取…

萌无敌 2024-08-29 20:34:02 7 0

如何使用替换矩阵修改 Smith-Waterman 算法以在 Perl 中对齐蛋白质?

如何使用 Smith-Waterman 算法 修改Perl 中对齐蛋白质的替换矩阵? [需要引用]…

黯淡〆 2024-08-10 08:38:12 8 0
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