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ESet 的子集 /除以 ESet

是否可以像这样对 ExpressionSet 进行子集化: SUB=ESet[,ESet@phenoData@data$x==c(0,1)] 是 0-9 的值,我只想要 x=0 或 x=1 时的条目。…

薄荷港 2024-11-02 20:22:13 2 0

Limma包-对比矩阵差异表达

我正在使用 limma 来分析差异基因表达。 对于建模,您需要设计和对比矩阵。我只是想知道是否有人有这方面的经验。 假设表达来自野生型(WT)和突变体…

呢古 2024-10-31 07:03:19 1 0

表达式集子集化

我有一个 ExpressionSet 对象,我想对其进行子集化。例如, &gt str(ESet) Formal class 'ExpressionSet' [package "Biobase"] .. ..@ assayData :.. …

冰葑 2024-10-31 04:40:16 3 0

我需要一个使用 R 的良好 Limma 教程

Closed. This question is seeking recommendations for software libraries, tutorials, tools, books, or other off-site resources. It does not …

心碎无痕… 2024-10-24 04:25:47 2 0

在 R 中,如何根据另一个对象的类设置 S4 类

我需要从 Bioconductor 的 ShortRead 库创建一个 ShortReadQ 类型的对象。 ShortReadQ 'signature(sread = "DNAStringSet", quality = "QualityScore"…

似梦非梦 2024-08-23 01:10:36 7 0

安装不是 .tar.gz 的本地包

我正在编写一个在当前目录中创建包的脚本(使用 BioConductor 中的 pdInfoBuilder),并且我想在脚本运行时安装它。 install.packages() 与 repo=NULL…

榆西 2024-08-07 00:34:12 4 0
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