在网络图中定义节点形状，并在R中使用附加属性表

Question

我正在绘制网络，其中包含两种不同类型的节点，我想以不同的形状可视化。为此，我制作了一个额外的表，我在其中指定了哪种结构是使用二进制系统的类型。现在，我想在我的情节函数中指定具有1个结构是三角形的结构，而其中的结构为0。 我的网络数据是相邻矩阵的格式（我使用igraph），并且我正在使用ggnet2进行绘图。

这就是我导入数据的方式：

am <- as.matrix(read.csv2("mydata.csv", header = T, row.names = 1))
g <- graph_from_adjacency_matrix(am, mode = "undirected")
attr <- read.csv2("myattributes.csv", header = T, row.names = 1)

这就是我要绘制它的方式，但我不知道如何指定shape函数，

ggnet2(g, size = "degree", node.color = "darkgreen", shape = ??????)

谢谢您的帮助！

Answer 1

请注意，绘制igraph s的软件包 - 引用ggnet2 include ggplot2，sna和网络< /代码>以及InterGraph作为桥梁。

当然，ggnet2更漂亮，但是igraph - way是：

g <- erdos.renyi.game(100,100,'gnm')
V(g)$shape <- sample(c('csquare','circle'), 100, replace=T)
plot(g, vertex.label = NA)

请注意，我添加了两个igraph style形状为vertex-attributes，以g多于。在ggent2中，您可以为向量提供形状，但它们可以是任何值（甚至是因子）或数字（通常的灰色圆圈是19。 ggnet2中的绘图

ggnet2(g, shape=19)
ggnet2(g, shape=10+round(1:100/10))
ggnet2(g, shape=factor(V(g)$shape))
V(g)$shape <- sample(c('One shape','Another shape'), 100, replace=T)
ggnet2(g, shape=V(g)$shape, size = "degree", node.color = "darkgreen")

，请注意，如果您在分别加载属性数据后向顶点添加属性（如上所述），则可能是这样的数据的非常 order> order 重要的网络数据活在不同的数据范围或宽松的向量中，以正确地可视化网络。