从两个字符之间的fasta基因名称中删除文本
我有一个大型密码子对齐，标题中具有各种基因名称。标题为以下格式：
>ENST00000357033.DMD.-1 | CODON | REFERENC
我想修改FastA中的所有标题，以在第一个“”之后排除所有字符。在第一个“ |”之前。预期的结果：
>ENST00000357033 | CODON | REFERENC
我尝试了一些SED命令，没有骰子。有建议吗？我不愿意使用尴尬，因为我想保持对齐方式的格式和尴尬。
谢谢你！
I have a large codon alignment that has a variety of gene names in the headers. The headers are in the following format:
>ENST00000357033.DMD.-1 | CODON | REFERENC
I want to modify all of the headers in the fasta to exclude all characters after the first "." and before the first "|". Desired outcome:
>ENST00000357033 | CODON | REFERENC
I've tried a few sed commands, no dice. Any advice? I'm averse to using awk, since I'd like to keep the formatting of the alignment and awk scares me.
Thank you!
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评论（2）
每行以a'＆gt;”开头更换“点”，然后是与空间不同的炭，然后是空间。
for each line starting with a '>' replace 'dot' followed by some char different from spaces followed by a space, by a space.
没有
awk害怕的neeed：no neeed to be scared by
awk: