如何在seurat dimheatmap函数中包括传奇

Question

是否有一种一般的方法可以在Seurat图中包含传说？例如，如果我的代码是，

DimHeatmap(norm_data3, dims = 1, cells = 500, balanced = TRUE)

我该如何包含与PCA组件值相对应的颜色的传奇？

Answer 1

有点模糊，但是您应该设置fast = false：

如果为true，请使用图像生成图；比使用ggplot2快，但是
无法自定义

是一个可再现的示例，使用pbmc_small来自seurat pacakage的数据集：

library(Seurat)
#> Warning: package 'Seurat' was built under R version 4.1.2
#> Attaching SeuratObject
#> Attaching sp
data("pbmc_small")
DimHeatmap(pbmc_small, dims = 1, cells = 500, balanced = TRUE, nfeatures = 4, fast = FALSE)
#> Warning: Requested number is larger than the number of available items (80).
#> Setting to 80.

^{在2022-06-30创建的 reprex package （v2.0.1）< /sup>}