如果您的一条列有不均匀的行，如何在R中分开列？

Question

我有一个.csv文件，其中我有一个列，每行25-30个字符。我需要将一列分为25列，每个列在每个列中都有自己的特征（或核苷酸）。因此，我将忽略每一行的额外0-5个核苷酸。

.csv文件看起来与此相似：

序列

• atcggtcggggggat
• tgctggcaaa accgtcgaa
• accgtcgaa
• actggtaattg

我需要表看起来与此相似：

sequence sequence

• atgct gtact
• ggtact ggtact
• ggtcc
• atggtg

ggtcc 对我来说，目标是试图找到每一列的核苷酸频率，这就是为什么我需要分开列的原因。

我是R的新手，因此，任何帮助都将不胜感激！

Answer 1

首先使用dput（）提供我们可以剪切/粘贴的数据。

Sequence <- c("ATCGGTCGGGGGAT", "TGCTGGCAAA", "ACCGTCGAA", "ACTGGTAATTG")

切碎您不需要的碎片，然后将其拆分：

Sequence <- substr(Sequence, 1, 5)
Sequence <- data.frame(do.call(rbind, strsplit(Sequence, "")))
Sequence
#   X1 X2 X3 X4 X5
# 1  A  T  C  G  G
# 2  T  G  C  T  G
# 3  A  C  C  G  T
# 4  A  C  T  G  G