SratoolKit:运行预摘要时错误:在虚拟文件系统模块中解析树时找不到路径
我一直在使用unix shell使用sratoolkit/2.8.2-1下载原始读取。 SRA文件来自NCBI数据库,例如“ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term = srx1157907”。当我使用prefetch命令(例如Prefetch SRR2172947)时,始终会在虚拟文件系统模块中解决树时找到“找不到路径的错误” - 'SRR2172948'找不到。”我可以没有问题下载其他SRA文件,例如SRR12626663,但是上述链接有一些问题。
是否有可能指导我解决这个问题?
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NCBI的SRA中的人类基因组学数据经常通过。必须请求访问这些文件并遵循特殊协议下载此类数据。例如,研究人员必须证明有效的研究需要获得访问批准,并同意遵循协议,以确保数据牢固存储。
Human genomics data in NCBI's SRA is often under controlled access through the dbGaP system. One must request access to these files and follow special protocols to download such data. For example, researchers must demonstrate valid research needs to gain access approval and agree to follow protocols to ensure the data is securely stored.