每个站点缺少数据
我想计算我的VCF文件中每个站点丢失数据的统计信息。
使用VCFTOOLS-失误站点给出了多个站点的错误统计数据。
还有其他计算方法吗？
谢谢你！
I want to calculate statistics of missing data per each site in my vcf file.
Using vcftools --missing-site gives wrong stats for several sites.
Is there is any other way to calculate it?
Thank you!
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评论（1）
使用
PLINK - MISSING您可以计算每个个人或VCF文件中每个变体的丢失。Using
plink --missingyou can calculate missingness per individual or per variant from a vcf file.