从另一个文件中的一个文件中查找模式

Question

我正在尝试从另一个文件中的一个文件中找到模式。

文件中的模式看起来像这样：

ENSG00000203875.13
ENSG00000262691.1
ENSG00000254911.3

文件两个包含：

ENSG00000203875.13 aa aaa bbb cc
ENSG00000227782.2
ENSG00000229582.3
ENSG00000241769.7
ENSG00000245904.4
ENSG00000254823.2
ENSG00000254911.3 cc ccc ccc
ENSG00000260213.6
ENSG00000260997.1
ENSG00000261799.1
ENSG00000262691.1 bbb bbb bbb
ENSG00000267249.1
ENSG00000270012.1
ENSG00000270091.1
ENSG00000270361.1
ENSG00000271533.1
ENSG00000271833.1
ENSG00000271870.1
ENSG00000272379.1
ENSG00000272631.1
ENSG00000273066.5
ENSG00000273855.1
ENSG00000278966.2
ENSG00000279332.1
ENSG00000279407.1
ENSG00000279616.1
ENSG00000279684.1
ENSG00000279835.1
ENSG00000286181.1
ENSG00000286986.1
ENSG00000287817.1

我试图仅

ENSG00000203875.13 aa aaa bbb cc
ENSG00000254911.3 cc ccc ccc
ENSG00000262691.1 bbb bbb bbb

作为输出找到。我很确定grep -f file_one.txt file_two.txt应该做这项工作，但是我只是将file_two的内容作为输出。我不知道我在犯什么错误。有人可以指出吗？

Answer 1

我会做类似的事情：

for i in $(cat file_one.txt); do grep -i $i file_two.txt; done
ENSG00000203875.13 aa aaa bbb cc
ENSG00000262691.1 bbb bbb bbb
ENSG00000254911.3 cc ccc ccc

Answer 2

您可以考虑使用awk方法，跟踪 file_one.txt array a的第一列的值，然后检查 file_two.txt 的第一列的值在数组的键中存在：

awk 'NR==FNR {a[$0]; next} $1 in a' file_one.txt file_two.txt

输出

ENSG00000203875.13 aa aaa bbb cc
ENSG00000254911.3 cc ccc ccc
ENSG00000262691.1 bbb bbb bbb

另一个选项使用GREP：

grep -f file_one.txt file_two.txt