如何在bash中等待直到壳脚本完成？

Question

现在，我正在将此脚本用于程序：

export FREESURFER_HOME=$HOME/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

cd /home/ubuntu/fastsurfer
datadir=/home/ubuntu/moya/data
fastsurferdir=/home/ubuntu/moya/output
mkdir -p $fastsurferdir/logs # create log dir for storing nohup output log (optional)

while read p ; do
  echo $p
  nohup ./run_fastsurfer.sh --t1 $datadir/$p/orig.nii \
                            --parallel --threads 16 --sid $p --sd $fastsurferdir > $fastsurferdir/logs/out-${p}.log &
  sleep 3600s
done < /home/ubuntu/moya/data/subjects-list.txt

而不是使用Sleep 3600s，因为该程序需要大约一个小时，我想使用等待直到所有进程（几个PID）完成。 如果这是正确的方法，您能告诉我如何做吗？

Br Alex

Answer 1

等待将等待所有背景过程完成（请参阅帮助等待）。因此，您需要的只是在创建所有背景过程之后运行等待。

Answer 2

这可能比您要求的要多，但我认为我将提供一些控制您要一次运行的线程数量的方法。我发现我总是想限制数字，原因各种原因。

解释

以下将限制并发线程一次运行。我还使用主设计模式，因此我们有一个主体，可以使用函数run_jobs运行脚本，该函数可以处理调用和等待。我将所有$ p的所有P读为一个数组，然后在启动线程时穿越该数组。它要么将启动一个长达4个线程，要么等待5秒，一旦至少一个小于4，它将启动另一个线程。完成后，等待剩下的任何要做。如果您想要更简单的事情，我也可以做到这一点。

#!/usr/bin/env bash

export FREESURFER_HOME=$HOME/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

typeset max_threads=4
typeset subjects_list="/home/ubuntu/moya/data/subjects-list.txt"
typeset subjectsArray

run_jobs() {
    local child="$"
    local num_children=0
    local i=0
    while [[ 1 ]] ; do
        num_children=$(ps --no-headers -o pid --ppid=$child | wc -w) ; ((num_children-=1))
        echo "Children: $num_children"
        if [[ ${num_children} -lt ${max_threads} ]] ;then
            if [ $i -lt ${#subjectsArray[@]} ] ;then
                ((i+=1))
                # RUN COMMAND HERE &
                ./run_fastsurfer.sh --t1 $datadir/${subjectsArray[$i]}/orig.nii \
                                --parallel --threads 16 --sid ${subjectsArray[$i]} --sd $fastsurferdir 
            fi
        fi
        sleep 10
    done
    wait
}


main() {
    cd /home/ubuntu/fastsurfer
    datadir=/home/ubuntu/moya/data
    fastsurferdir=/home/ubuntu/moya/output
    mkdir -p $fastsurferdir/logs # create log dir for storing nohup output log (optional)

    mapfile -t subjectsArray < ${subjects_list}
    run_jobs
}

main

注意：我没有运行此代码，因为您没有提供足够的信息来实际使用。