如何使用 MPE 进行 MPI c++项目？

Question

MPE对于可视化MPI程序非常有用，但是它仅为C和Fortran提供编译器包装器： MPECC 和 MPEF77 。如果我的MPI项目是用C ++编写的，并且通常使用 MPIC ++ ，而不是 MPICC （因此无法使用 MPECC编译，我该如何使用它。 ）？

如何设置（1）MPE库本身和（2）我的C ++项目？

Answer 1

答案实际上很简单，尽管如此，我已经挣扎了几天。

下面显示的步骤可与Linux（Ubuntu 18）上的MPICH 3.3.2一起使用WSL2运行 - 在不同的Evnironments中可能需要进行一些调整。

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C ++的MPE库设置

您正常设置MPE库，就像C项目相同的方式 - 必要的步骤是：

1. 下载并提取最新的MPE档案（我使用过 mpe 2-1.4.9 来自在这里）

2. 导航到提取的目录：

   CD MPE2-2.4.9B

3. 配置库的构建过程 - 在我的情况下，以下命令工作：

   ./ configure mpi_cc = mpiCc mpi_f77 = mpif77 prefix = $ home/installs/mpe2 mpi_cflags = -pthread mpi_fflags = -pthread

   说明：

   • mpe是在C中编写的，因此我们使用 MPICC 对其进行编译 - 我们还没有（尚未）指定如何构建我们的项目，因此我们不使用MPIC ++。如果我们使用 MPIC ++ 作为 mpi_cc ，则MPE库不会编译。
   • 指定fortran标志不是严格必要的，但是这样我们避免了编译输出中的不确定错误
   • 前缀（安装路径）是您选择的任意路径，请记住您在此处插入的内容，因为需要进一步的步骤
   • 我必须提供 pthread library的手动链接 - 这可能/可能不是必不可少的，具体取决于您的系统

4. 我必须提供 pthread 库的手动链接 - 根据您的系统

   编译MPE库：

   ，

   make

5. 安装编译库：

   使安装

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使用C ++项目中的MPE

因为我们不能使用预定义的编译器包装器 mpecc 来编译C ++，我们必须手动链接必要的库，就像我们一样将与任何其他库一起使用。

假设我们有一个文件 main.cpp 带有以下内容：

#include <mpi.h>
#include <mpe.h>

/* other necessary includes */

int main(int argc, char** argv) {
    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPE_Init_log();

    /* some MPI and MPE stuff */

    MPE_Finish_log("test");
    MPI_Finalize();
}

允许使用MPI和MPE调用构建C ++文件的特定命令为：

mpic ++ main.cpp -o main -i main -i/$ home/installs/mpe2/include -l/$ home/installs/mpe2/lib -lmpe -pthread

说明：

• 我们使用 mpic ++ 来链接所有mpi项目自动
• $ $ home 时指定的任意安装路径。
• /installs/mpe2 是您在配置MPE库 -i flag ）
• -l <​​/code> flag告诉编译器在哪里可以找到编译的库项目（在随附的标头文件中定义的函数的实现）
• -l <​​/code> flag告诉编译器实际链接我们可以使用特定库的可执行文件（这要感谢我们使用 -L flag Specyfing搜索位置），
• 我必须链接 pthread 手动以使MPE工作，但这可能取决于在系统上，

如果您使用 cmake 构建项目，则以下cmakelists.txt应该有效：

cmake_minimum_required(VERSION 3.5)  # not necessarily 3.5, it;s just my setup

project(mpi_test)  # arbitrary project name

find_package(MPI REQUIRED)
set(CMAKE_CXX_COMPILER mpic++)

include_directories($ENV{HOME}/installs/mpe2/include)  # again, it's the MPE installation path
link_directories($ENV{HOME}/installs/mpe2/lib)  # again, it's the MPE installation path

add_executable(main_exp src/main_exp.cpp)
target_link_libraries(main_exp mpe pthread)  # again, pthread may/may not be neccessary