为 Snakemake DAG 中的每条规则指定颜色
我正在运行snakemake -n -c1 -dag |点-TSVG＆gt; dag.svg获取DAG文件。 我想知道我是否可以以某种方式为每个节点设置配色方案。例如，在下图中，规则samtools_fixmate与samtools_sort和samtools_markduplicates的颜色不同。您可以在snakemake文件中以某种方式指定节点应该是什么颜色？
我将安顿下来的解决方案。
I'm running snakemake -n -c1 --dag | dot -Tsvg > dag.svg to get the DAG file.
I was wondering if I could somehow set the color scheme for every node. For example, in the picture below, rule samtools_fixmate is of different color from samtools_sort and of samtools_markduplicates. Can you somehow specify within snakemake file what color the nodes should be?
I'll settle even for out-of-snakefile solutions.
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评论（1）
与此答案类似，您可以将 dag 导出到点文件中：
然后可以根据需要编辑点文件。
Similar to this answer, you can export the dag into a dot file:
The dot file can then be edited as necessary.