ggtree：如何以最简单的方式标记树枝

发布于 2025-01-14 16:38:44 字数 262 浏览 5 评论 0原文

我想在树上标记特定分支（例如“组 1”），但我没有找到执行此操作的特定函数。有什么想法吗？

set.seed(123)
tree <- rtree(30)
plot(tree)

原文

I want to label a specific branch (e.g., "Group 1") on the tree, but I didn't found a specific function to do that. Any ideas?

set.seed(123)
tree <- rtree(30)
plot(tree)

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池予 2025-01-21 16:38:45

您实际上并没有使用 ggtree 来绘制此处。如果你想用 ggtree 来绘制树，你可以这样做：

library(ggtree)
library(ggplot2)

set.seed(123)
tree <- rtree(30)

ggplot(tree) + 
  geom_tree() +
  geom_tiplab() +
  geom_text(aes(0.5, 20), label = 'Group 1', 
            check_overlap = TRUE, color = 'red', size = 6) +
  theme_void()

< img src="https://i.sstatic.net/lNcsd.png" alt="在此处输入图像描述">

You're not actually using ggtree to plot here. If you wish to draw your tree with ggtree you could do something like this:

library(ggtree)
library(ggplot2)

set.seed(123)
tree <- rtree(30)

ggplot(tree) + 
  geom_tree() +
  geom_tiplab() +
  geom_text(aes(0.5, 20), label = 'Group 1', 
            check_overlap = TRUE, color = 'red', size = 6) +
  theme_void()