newick 格式:右括号后直接数字?
我有一个 Newick 格式的系统发育树。完整字符串的示例如下所示: “...(tet_rpg.hmm_GCA_000638155.1_seq1:0.001565531,tet_rpg.hmm_GCA_000507745.1_seq1:0.001565235)0.000:5e-09,...”。我知道距离是由冒号后面的数字给出的,但是紧跟在右括号后面的数字表示什么?在上面的示例中,“0.000”代表什么?
I have a phylogenetic tree in Newick format. A sample from the full string looks like this:
"...(tet_rpg.hmm_GCA_000638155.1_seq1:0.001565531,tet_rpg.hmm_GCA_000507745.1_seq1:0.001565235)0.000:5e-09,...". I understand that distances are given by the number after a colon, but what do numbers immediately following closed parentheses signify? In the sample above, what does "0.000" represent?
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评论(1)
这是引导值。进化枝存在的置信度。
经典源码
This is bootstrap values. The confidence level of clade existence.
Classic source