如何更新 DICOM 研究的所有 UID,同时保持其结构?

发布于 2025-01-11 11:02:57 字数 361 浏览 0 评论 0原文

我有一个 3 系列的 DICOM 研究,想要刷新它的 UID(StudyInstanceUID、SeriesInstanceUID、SOPInstanceUID)来进行一些测试。所有数据都在一个目录中,因此无法判断哪个 DICOM 属于哪个系列。

我尝试过使用 dcmodify (dcmtk) 和一些生成选项:

dcmodify mydirectory/*.dcm -gst -gse -gin

但它使所有单个文件进行不同的研究,结构被破坏。

有没有办法做到这一点,或者我是否必须使用其他 dcmtk 工具来识别每个文件都有的系列 UID?

I have a DICOM study with 3 series and want to refresh its UIDs (StudyInstanceUID, SeriesInstanceUID, SOPInstanceUID) to do some tests. All the data is in a single directory so it's not possible to tell which DICOM belongs to which series.

What I have tried is using dcmodify (dcmtk) with some generate options :

dcmodify mydirectory/*.dcm -gst -gse -gin

but it makes all single files different studies, the structure was broken.

Is there a way to do this or do I have to use other dcmtk tools to identify series UIDs that every single file has?

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评论(1

忆梦 2025-01-18 11:02:57
-gst -gse and -gin

为每个匹配 mydirectory/*.dcm 的单独图像创建一个新的研究、系列和 SOP 实例 UID,从而破坏您已经观察到的研究/系列结构。

答案有两个:
要将相同的 UID 分配给所有图像,您宁愿使用

-m (0020,000D)=... 

(此示例为研究实例 UID),

但据我所知,DCMTK 中没有命令行工具可以完全解决您的问题。 storecp 可以选择为每个研究创建子目录(例如 --sort-on-study-uid),但这并不能解决系列级别的问题。

通过 DCMTK 的方法,我认为您需要使用 dcmdump 来完成一些脚本工作,将文件转储为文本,从中提取 Study- 和 Series 实例 UID,然后将文件移动到适当的位置。研究+系列文件夹。

-gst -gse and -gin

Create a new Study-, Series and SOP Instance UID for each individual image matching mydirectory/*.dcm, hence destroying the study/series structure as you already observed.

The answer is two-fold:
To assign the same UID to all images, you rather use

-m (0020,000D)=... 

(this example for the Study Instance UID)

But there is no command line tool in DCMTK that I am aware of which would completely solve your problem. The storescp has an option to create subdirectories for each study (e.g. --sort-on-study-uid) but that does not solve the series-level problem.

With the means of DCMTK, I think you need to do some scripting work around it using dcmdump to dump the files to text, extracting Study- and Series Instance UID from it and then moving the file to an appropriate Study+Series folder.

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