将 DICOM 转换为 TIFF

Question

我是 Python 新手，所以如果我的信息不正确，请原谅我的无知。我正在尝试对目录进行光栅处理，并将其中的所有 DICOM 文件转换为 TIFF 文件。我已经可以使用搜索功能，但我很难将图像保存为 TIFF。我正在使用 pydicom 库读取 DICOM 并操作标头信息。另外，我尝试使用pydicom中的save_as函数保存到TIFF，但我宁愿使用PIL中的save函数来正确设置TIFF的压缩。我认为问题是我不能/不明白如何从 DICOM 中提取实际图像数据并将其放入新图像中。任何帮助将不胜感激......干杯

Python 2.7 皮尔1.1.7 皮迪康0.9.6

Answer 1

在网上找到了同一查询的答案，虽然我不记得该网站，但当我将其应用到我的代码时，也在这里为其他人共享：

 import pylab
 import dicom
 ImageFile=dicom.read_file(<SourceFilePath>) #Path to "*.dcm" file
 pylab.imshow(ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone) #to view image

或者如果您想保存图像，则使用：
pylab.imsave('',ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone)

imsave 默认情况下会将图像保存在 中。 png 格式。如果支持，您可以在 imsave() 中指定所需的格式。

希望它有用。

Answer 2

如果您知道如何使用 PIL 将图像数据保存为 .tiff，这个示例应该可以帮助您将图像数据从pydicom传递到PIL（还有更多在评论中）。