强制结构决策树
我一直在 R 中使用决策树(CART),使用 rpart 包来查看 SST(预测变量)和气候(预测变量)之间的关系。
我想“强制”树进入特定的结构 - 即在预测变量 1 上分割,然后在变量 2 上分割。
我已经使用 R 一段时间了,所以我认为我能够查看 rpart 函数背后的代码并修改它以首先在特定预测变量中搜索“最佳分割”。然而,rpart 函数调用 C 例程,并且没有任何 CI 经验,所以在这里迷失了……
我可以从头开始编写一个函数,但如果可能的话,希望避免它!所以我的问题是:
- 是否还有另一种决策树技术(在 R 中实现) 最好)您可以在其中强制树的结构?
- 如果没有 - 有什么方法可以将 C 代码转换为 R 代码吗?
- 还有其他想法吗?
提前致谢,非常感谢您的帮助。
I have been using decision trees (CART) in R using the rpart package to look at the relationship between SST (predictor variables) and climate (predictand variable).
I would like to "force" the tree into a particular structure - i.e. split on predictor variable 1, then on variable 2.
I've been using R for a while so I thought I'd be able to look at the code behind the rpart function and modify it to search for 'best splits' in a particular predictor variable first. However the rpart function calls C routines and not having any experience with C I get lost here...
I could write a function from scratch but would like to avoid it if possible! So my questions are:
- Is there another decision tree technique (implemented in R
preferably) in which you can force the structure of the tree? - If not - is there some way I could convert the C code to R?
- Any other ideas?
Thanks in advance, and help is much appreciated.
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评论(2)
当您的数据指示具有已知结构的树时,请使用 newick 或 nexus 文件格式将该结构呈现给 R。然后,您可以使用 Phylo 包中的 read.tree 或 read.nexus 读取该结构。
When your data indicates a tree with a known structure, present that structure to R using either a newick or nexus file format. Then you can read in the structure using either read.tree or read.nexus from Package Phylo.
也许你应该看看
文档中的
rpart
的method
形式参数:Maybe you should look at the
method
formal parameter ofrpart
In the documentation :