python中如何合并两个文件

Question

我有两个制表符分隔的 csv 文件（带标题），需要在 python 中合并。

另外，在合并的文件中，我想在末尾添加一列来标识文件，因为虽然它们具有相同的格式，但它们具有不同的数据，我稍后需要将其分开。 因此，我想在输出的每一行添加一个名为“source”的列，其中 file1 为 0，file2 为 1。

我已经使用了 csv 模块，但 writerow 在它写入的每一行之间添加了一个附加的换行符，并且此代码不会从 file2 中写入任何内容。我在这里做错了什么？另外，如何在 line 对象中添加额外的列“source”？

import os, csv

path1 = os.path.abspath("../data/file1.txt")
path2 = os.path.abspath("../data/file2.txt")
merged_path = os.path.abspath('../data/output.txt')

# merge the two files for further processing
merged_file = csv.writer(open(merged_path, 'a'), delimiter = '\t')

#file1
fg = csv.reader(open(path1, 'r'), delimiter = '\t')

for line in fg:
    if line[7] != '\N':
        merged_file.writerow(line) 

#file2
bg = csv.reader(open(path2, 'r'), delimiter = '\t')

for line in bg:
    if line[16] != '\N':
        merged_file.writerow(line) 

Answer 1

我更喜欢使用 dictWriter 来实现此目的。此外，您的代码不起作用，因为 csv 库需要以 binary 模式打开文件。

import os, csv

path1 = os.path.abspath("../data/file1.txt")
path2 = os.path.abspath("../data/file2.txt")
merged_path = os.path.abspath('../data/output.txt')

#file1
fg = csv.DictReader(open(path1, 'rb'), delimiter = '\t')

fieldnames = fg.fieldnames
fieldnames.append('source')
# merge the two files for further processing
merged_file = csv.DictWriter(open(merged_path, 'ab'), delimiter = '\t', fieldnames=fieldnames)
merged_file.writeheader()

for row in fg:
    row['source'] = os.path.basename(path1)
    merged_file.writerow(row)

#file2
bg = csv.DictReader(open(path2, 'rb'), delimiter = '\t')

for row in bg:
    row['source'] = os.path.basename(path1)
    merged_file.writerow(row)