使用 aparapi 计算编辑距离

Question

我正在研究使用 APARAPI 实现 Levenshtein 距离算法的可能性，但我遇到了 限制 - 具体来说，我需要在内核中创建一个被禁止的数组。

有没有办法解决这个问题，或者更好的是有人有一种与 APARAPI 一起使用的 Levenshtein 距离方法吗？

附加的代码正好可以尝试对 APARAPI 内容进行排序，我知道我没有对结果做任何事情，我现在只是执行一次。

   Kernel kernel = new Kernel() {


        @Override
        public void run() {
            ld("hello", "heya");
        }

        public int ld(String s, String t) {
            int d[]; // matrix
            int n; // length of s
            int m; // length of t
            int i; // iterates through s
            int j; // iterates through t
            int s_i; // ith character of s
            int t_j; // jth character of t
            int cost; // cost

            // Step 1

            n = s.length();
            m = t.length();
            if (n == 0) {
                return m;
            }
            if (m == 0) {
                return n;
            }
            int firstSize = n+1;
            d = new int[firstSize*(m + 1)]; //THIS ISN'T ALLOWED

            // Step 2

            for (i = 0; i <= n; i++) {
                d[firstSize*i+0] = i;
            }

            for (j = 0; j <= m; j++) {
                d[firstSize*0+j] = j;
            }

            // Step 3

            for (i = 1; i <= n; i++) {

                s_i = s.charAt(i - 1);

                // Step 4

                for (j = 1; j <= m; j++) {

                    t_j = t.charAt(j - 1);

                    // Step 5

                    if (s_i == t_j) {
                        cost = 0;
                    } else {
                        cost = 1;
                    }

                    // Step 6
                    int a = d[firstSize*(i - 1)+j] + 1;
                    int b = d[firstSize*i+(j - 1)] + 1;
                    int c = d[firstSize*(i - 1)+(j - 1)] + cost;

                    int mi;

                    mi = a;
                    if (b < mi) {
                        mi = b;
                    }
                    if (c < mi) {
                        mi = c;
                    }

                    d[firstSize*i+j] = mi;

                }
            }

            return d[firstSize*n+m];

        }
    };
    kernel.execute(1);

Answer 1

正如您所指出的，Aparapi 不允许在内核主体中出现任何形式的 new ，但是您可以预先分配内核代码可以访问的整数缓冲区。

此外，因为您可以在运行时确定组大小，所以您的缓冲区不必很大，但 Kernel.getGroupSize() 的合理比例/比率即可。

当然，您需要将参数从 String 转换为 char[] 以满足 Aparapi 的对象限制（不允许使用字符串），但我认为从 aparapi 讨论列表上的类似线程中您已经找到了解决方法。

如果您准备尝试一些“实验代码”，我在 SVN 中有一个标记为 SupportLocalMemory 的分支，它允许您将临时 int[] 缓冲区放置在本地内存中，这也应该具有更高的性能。

加里