当“warnings()”出现时中断循环出现在R中

Question

我有一个问题： 我正在运行一个循环来处理多个文件。我的矩阵非常巨大，因此如果我不小心，我经常会耗尽内存。

如果创建任何警告，是否有办法打破循环？它只是继续运行循环并报告它在很久以后失败......烦人。聪明的 stackoverflow-ers 有什么想法吗？！

Answer 1

您可以通过以下方式将警告转化为错误：

options(warn=2)

与警告不同，错误会中断循环。很好的是，R 还会向您报告这些特定错误是从警告转换而来的。

j <- function() {
    for (i in 1:3) {
        cat(i, "\n")
        as.numeric(c("1", "NA"))
}}

# warn = 0 (default) -- warnings as warnings!
j()
# 1 
# 2 
# 3 
# Warning messages:
# 1: NAs introduced by coercion 
# 2: NAs introduced by coercion 
# 3: NAs introduced by coercion 

# warn = 2 -- warnings as errors
options(warn=2)
j()
# 1 
# Error: (converted from warning) NAs introduced by coercion

Answer 2

R 允许您定义一个条件处理程序，

x <- tryCatch({
    warning("oops")
}, warning=function(w) {
    ## do something about the warning, maybe return 'NA'
    message("handling warning: ", conditionMessage(w))
    NA
})

该处理程序会导致

handling warning: oops
> x
[1] NA

在 tryCatch 之后继续执行；您可以决定通过将警告转换为错误来结束

x <- tryCatch({
    warning("oops")
}, warning=function(w) {
    stop("converted from warning: ", conditionMessage(w))
})

或优雅地处理条件（在警告调用后继续评估），

withCallingHandlers({
    warning("oops")
    1
}, warning=function(w) {
    message("handled warning: ", conditionMessage(w))
    invokeRestart("muffleWarning")
})

打印

handled warning: oops
[1] 1

Answer 3

设置全局 warn 选项：

options(warn=1)  # print warnings as they occur
options(warn=2)  # treat warnings as errors

请注意，“警告”不是“错误”。循环不会因警告而终止（除非 options(warn=2)）。