在 Mac OS 中启动 R statet

Question

我的操作系统是 Mac OS Lion

当我在 eclipse 中启动 R（成功安装 statet 后，在 R 和 bash 中安装包“rjava、rj 和 rj-gd”）时，我仍然收到图片中的错误消息。

在 ecipse.ini 中我指定了一个 vm iee

-vm
/usr/bin/java

错误日志具有以下几行。任何帮助将不胜感激

Launching the R Console was cancelled, because it seems starting the R engine failed. 
Please make sure that R package 'rj' (0.5.5 or compatible) is installed and that the R library paths are set correctly for the R environment configuration 'R'.
Process Error Log:
Nov 17, 2011 4:26:41 PM de.walware.rj.server.RMIServerControl start
INFO: [Control:rjs-local-1321543599373] initialize server...
Nov 17, 2011 4:26:41 PM de.walware.rj.server.srvImpl.AbstractServerControl initREngine
SEVERE: [Control:rjs-local-1321543599373] init JRI/Rengine failed.
java.lang.NoClassDefFoundError: de/walware/rj/server/dbg/TracepointListener
    at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)
    at java.lang.ClassLoader.defineClassCond(ClassLoader.java:631)
    at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:615)
    at java.security.SecureClassLoader.defineClass(SecureClassLoader.java:141)
    at java.net.URLClassLoader.defineClass(URLClassLoader.java:283)
    at java.net.URLClassLoader.access$000(URLClassLoader.java:58)
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:197)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:190)
    at de.walware.rj.server.jri.loader.JRIClassLoader.findClass(JRIClassLoader.java:514)
    at de.walware.rj.server.jri.loader.JRIClassLoader.loadRJavaClass(JRIClassLoader.java:746)
    at de.walware.rj.server.jri.loader.JRIServerLoader.loadServer(JRIServerLoader.java:82)
    at de.walware.rj.server.srvImpl.AbstractServerControl.initREngine(AbstractServerControl.java:145)
    at de.walware.rj.server.RMIServerControl.start(RMIServerControl.java:104)
    at de.walware.rj.server.RMIServerControl.main(RMIServerControl.java:41)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: de.walware.rj.server.dbg.TracepointListener
    at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:202)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:190)
    at de.walware.rj.server.jri.loader.JRIClassLoader.findClass(JRIClassLoader.java:514)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:306)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:247)
    ... 15 more

Answer 1

对于这个问题有一个非常简单的解决方案。我是在更新StatET插件后遇到的。

StatET IDE 发生了很大变化，它需要新版本的 RJ 库（请参阅R 包的安装部分RJ）。

要安装 RJ 1.0 (StatET 2.0.x)，请键入以下命令：

install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.0")

R 控制台将再次工作。
希望有帮助。

Answer 2

在 OS X 安全更新后我遇到了完全相同的问题，我尝试了一下并想向您展示我的“解决方案”。我正在重新安装所有内容，也许这不是必需的，但它有效。

我重新安装，因为我认为这是 Java 1.6.0_29 问题，并且在 OS XI 上现在不知道如何降级 java 安装。请参阅此处

删除旧的 R并安装最新版本2.14（R版本2.14不存在rj 0.5）

rm -rf /Library/Frameworks/R.framework /Applications/R.app
wget http://cran.r-project.org/bin/macosx/R-2.14.0.pkg
[run installer]
r
> install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.0")
[...]

我还重新安装了Eclipse并将其更新到版本3.7.1
添加插件（帮助 -> 安装新软件 -> 来自 StatET for Eclipse 3.7 的 URL）

现在运行配置中的一些 Eclipse 配置：

• 我使用了“工作区默认 JRE (JVM 1.5.0)”，这可能不是这样important

最重要的配置（对我来说也是如此）可能是 R 库的路径。如果您没有以管理员身份登录（或具有管理员权限），jr 库将写入您的主目录：~/Library/R/2.14/library。您必须在 R 配置中添加此目录（Eclipse -> Preferences -> StatET -> Run/Debug -> R Environment -> Edit）

图像为 此处（作为未注册用户，我不允许集成图像）

这对我有用，到目前为止一切似乎都很好。

关于我的配置：

• OS X 10.6.8

Eclipse 3.7.1

• StatET 1.0.0
• Java 10.6.0_29（java 版本）
• R 2.14
  • rj_1.0.2-5
  • rj.gd_1.0.2-2