使用 C# Process 运行可执行程序

Question

我是一名生物信息学人员，我的工作使用 C#。我已经多次使用 C# 中的进程来运行可执行程序。这次我有一个新问题。我在 Windows 中下载了一个名为 Blast 的程序的 exe 文件(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=下载）。如果我输入我的命令：

blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt

它工作正常。但是当我从记事本复制粘贴命令时，会出现错误。我搜索了这个问题，发现这是一个“编码问题UTF-8与ISO-latin”（http://biostar.stackexchange.com/questions/7997/an-error-by-using-ncbi-blast-2-2-25-on-windows），这是由复制并粘贴。

现在我想从 C# 运行进程来调用 exe 文件，我遇到了同样的问题，我猜这是因为该进程执行了复制和粘贴之类的操作。这是我的代码：

 public void Calculate()
    {
        Process proc = new Process();
        proc.StartInfo.WorkingDirectory = Program.NCBIBlastDirectory;
        proc.StartInfo.FileName = @"C:\Program Files\NCBI\blast-2.2.25+\bin\blastp.exe";
        proc.StartInfo.Arguments = "blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt";
        proc.StartInfo.UseShellExecute = false;
        proc.StartInfo.RedirectStandardError = true;
        proc.StartInfo.RedirectStandardError = true;
        proc.Start();
        proc.WaitForExit();
        proc.Close();
    }

您知道我该如何解决这个问题吗？

提前致谢。

Answer 1

我可以看到的一个问题是在您设置参数的行中：

proc.StartInfo.Arguments = "blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt";

我认为您的意思是：

proc.StartInfo.Arguments = "-query input.txt -db pdbaa -out output.txt";

所以您不需要在参数中再次指定可执行文件名称 - 这就是 FileName 的用途。

另一件事是，有很多应用程序如果不使用 shell-execute 来启动它们，它们的行为就不会很好。首先使用 shell-execute 尝试一下（显然没有重定向任何 std*），如果它以这种方式工作，那么你就会知道问题是什么 - 尽管我担心你对此无能为力。

另外，为什么该行

proc.StartInfo.RedirectStandardError = true;

重复两次？