从 Gene Symbol 获取 SwissProt ID，反之亦然

Question

我是 Bioconductor 的新手，正在尝试找到合适的软件包来完成我想做的事情..即提供 SwissProt ID 并提供基因符号，反之亦然。

有很多包裹，我不知道我想要哪一个，有人能快速回答吗？

Answer 1

您可以采取的一种方法是使用有机体包：

library(org.Hs.eg.db)

假设我的基因符号就像此处键中的符号：

keys <- c("A1BG","A2M","A2MP1","NAT1","NAT2","AACP")

那么您可以仅使用 select() 方法（这适用于 R-2.14 及更高版本）。

select(org.Hs.eg.db, cols=c("SYMBOL", "UNIPROT"), keys= keys, keytype="SYMBOL")

希望这有帮助！