如何在 python 中输入文件并对其运行异步命令？

发布于 2024-12-12 02:47:42 字数 504 浏览 0 评论 0原文

我正在尝试编写一个脚本，要求输入文件，然后对其运行一些命令。当我运行脚本时，它会要求我提供文件名，当我给出文件（例如 example.bam）时，我会收到此错误：

NameError：名称“example.bam”未定义

我尝试了很多方法，但无法修复它。有人能告诉我出了什么问题吗？

这是我的命令：

from subprocess import call
filename = input ("filename: ");
with open (filename, "r") as a:
    for command in ("samtools tview 'a' /chicken/chick_build2.1_unmasked.fa",):
        call(command, shell=True)

这是我的命令的简短版本：它必须做更多的事情。我还想同时输入4-6个文件（也许这个信息有助于澄清我的意图）。

原文

I'm trying to write a script that asks for an input file and then runs some command on it. when I run the script it askes me for filename and when I give the file (e.g example.bam) then I get this error:

NameError: name 'example.bam' is not defined

I tried many things but I couldn't fix it. Can someone tell me what is wrong?

This is my comand:

from subprocess import call
filename = input ("filename: ");
with open (filename, "r") as a:
    for command in ("samtools tview 'a' /chicken/chick_build2.1_unmasked.fa",):
        call(command, shell=True)

This is a short version of my command: it has to do much more stuff. I'm also thinking to input 4-6 files at same time (perhaps this information is helpful to clarify my intentions).

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千纸鹤带着心事 2024-12-19 02:47:42

input 相当于 eval(raw_input(prompt))。因此，您的脚本当前尝试执行的操作是解释您的输入（在您的情况下为“示例”），并像脚本中的语句一样执行。对于用户输入（我可以简单地说“对于任何输入”——除非您知道自己在做什么），请始终使用 raw_input 函数。

因此，要解决这个问题，请将 input 替换为 raw_input：

filename = raw_input("filename: ")

input is equivalent to eval(raw_input(prompt)). So what your script currently tries to do is interpret your input ("example", in your case), and execute as if it were a statement in your script. For user input (and might I simply say "for any input" -- unless you know what you're doing), always use the raw_input function.

So, to solve it, replace input with raw_input: